北京大学第一医院抗感染科成立于1980年3月24日，由我国著名临床药理学家李家泰教授创建并任首任所长。为我国第一个临床药理研究所，是我国临床药理高级学术研究机构和抗生素研究中心之一。1983年成为我国最早的卫生部药物临床研究基地。

1995年国家科委、卫生部和国家医药管理局共同确定在北京大学临床药理研究所筹建国家抗感染新药临床试验研究中心，1999年12月通过国家科技部生命发展中心组织专家组考核验收，确定为“国家新药(抗感染药)临床试验研究中心”。 2000年初经国家药品监督管理局再论证确认为“国家药品临床研究基地”（抗感染药物）和“全国临床药理与GCP培训中心”。 2005年通过国家药品食品监督管理局、卫生部的药物临床研究机构复审。

抗感染病房主要收治发热待查、呼吸道感染、尿路感染、皮肤软组织感染等患者，对于细菌感染性疾病合理使用抗菌药物，在耐药菌感染治疗上有优势。

抗感染科包括病房和门诊

1.抗感染病房：位于北大医院第二住院部，共设床位12张，现有医师13名，其中主任医师3名，副主任医师8名，主治医师2名，护士7名，13名医师中6人具有博士学位、7人具有硕士学位。

2.抗感染门诊：位于北大医院门诊大楼内（厂桥），二楼222房间，由各级医师出诊。