首都医科大学附属北京儿童医院血液肿瘤中心于上个世纪八十年代开始进行小儿腹膜透析治疗，1994年4月成立了儿童血液透析室，在国内率先开展了儿童腹膜透析和血液透析治疗，并于2002年挂牌成为北京市儿童血液净化中心，是国内成立最早、规模最大的儿童专业血液净化中心。

科室创始人沈颖教授是国内外知名专家，博士生导师，儿童慢性肾脏病与血液净化北京市重点实验室主任。1995-1997年赴意大利都灵女皇儿童医院肾科深造。1994在国内率先开展儿童血液透析治疗，2002年建立国内规模最大的小儿血液净化中心，举办十余期全国小儿肾脏及血液净化学习班。

2010年组建了中国医师协会儿科分会血液净化专委会，主编了我国第一部儿童血液净化专业书籍，将小儿血液净化技术推广至全国。

经过近30年的稳步发展，几代人的共同努力，血液净化专业医疗及科研水平达国内先进水平并与国际接轨。在此基础上，2020年在医院重点支持下成为独立科室—北京儿童医院血液净化中心。自此，医院血液净化中心进入全新的发展时期。

北京儿童医院血液净化中心技术力量雄厚，拥有医护人员10余名，所有的医护人员均具有丰富的血液净化知识和临床经验，开设床位10余张，拥有世界上最先进的血液透析机11台，CRRT机4台，全自动腹膜透析机4台，目前已治疗1000余例儿童患者，累计2.5万余人次，承担了肾脏、急救、血液肿瘤及神经内科等专业不同病因患儿的血液净化治疗工作。

开展儿童血液透析、腹膜透析、血液灌流、血浆置换、免疫吸附、持续床旁血液滤过等血液净化技术，危重肾脏疾病的血液净化治疗水平居于全国领先地位。