北京市健宫医院心血管外科包括心脏外科专业、胸外科专业和血管外科专业，是北京大学医学部心血管外科学系的临床培训基地。依托华润医疗集团的先进管理模式和北京大学医学部心血管外科学系的技术后盾，医院心胸血管外科的技术水平得以持续、稳定发展。

心脏外科专业以冠状动脉搭桥手术为特色，并采用内窥镜技术获取冠脉搭桥血管，充分体现微创手术最佳效果、最小创伤的优势。同时也开展小切口冠脉搭桥手术。科室还常规开展大血管疾病的开放和介入手术，瓣膜成形／置换手术，先天性心脏病开放及介入封堵手术。

胸外科科专业拥有国内较为先进的STORZ高清胸腔镜，可以在电视胸腔镜下完成各种复杂的胸外科微创治疗。目前科室开展了包括肺癌、食管癌在内的胸科常见的良、恶性肿瘤手术，并可开展纵疾病常规及微创手术。

血管外科专业已成功开展包括颈动脉狭窄在内的外周血管疾病的介入和手术治疗，同时可以为透析患者建立各种类型的透析通路，已开展动静脉造瘘、复杂造瘘、透析通路的维护等。可独立完成下腔静脉滤器植入＋深静脉血栓取出术等下肢血管疾病的手术和介入治疗，挽救缺血坏死肢体和糖尿病足等多项技术。