北京协和医院全科（普通内科）的建立起始于美国纽约中华医学基金会项目“面向21世纪建设高质量、低成本的中国学术性城市医疗卫生体系的计划”。2001年4月，北京协和医院在院领导的支持下，在内科学系统一协调下，成立了综合内科病房，制定了多学科联合查房制度。2004年3月，内科学系独立三级学科-普通内科在北京协和医院率先成立。作为国内第一个集医教研为一体的学术性普通内科，为不同患者人群提供多层次的医疗服务：

内科常见病、多发病患者：为患者提供基本医疗与专科医疗相互协调的高质量的医疗服务。

难以分辨就诊专科的患者：包括多系统损害诊断未明或共病需要协调诊治的患者。

科室特色门诊包括痛风专病门诊：为痛风患者进行诊断和药物治疗，同时注重长期随诊和非药物干预。

普内全科门诊：面向东城等邻近社区开放，预约转诊患者，满足社区患者分级诊疗的需要。

普内疑难病门诊：在兄弟科室的支持下，成为北京协和医院的内科疑难病诊治平台，成功诊治了来自全国各地的大量疑难病、罕见病患者。