北京市第六医院血液内科，于2007年成立为独立科室，血液内科目前病床15张，主要诊治各种原因引起的贫血、全血细胞、各型白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、骨髓增殖性疾病。

血液内科拥有一支医术精湛、医德高尚的、高素质的医护专业队伍。技术力量较雄厚。与北京大学人民医院血研所长期合作，黄晓军所长、许兰平教授等定期查房，给予技术指导，对于临床各类血液系统疾病诊治有较多经验。

血液内科与北京大学人民医院血研所合作，自2002年即开展骨髓形态学检查、骨髓活检、免疫分型、融合基因检测、染色体检测等检查，结果具权威性。为许多外地来京患者进行了及时正确的诊治。

近年来，医院积极参与北大人民医院的科研课题，曾参与急性早幼粒细胞白血病诊疗的863计划、参与恶性血液病异基因骨髓移植后针对移植物抗白血病效应的“北京方案”，积极与北京市脐血库联系，多次进行供者淋巴细胞采集及输注，为部分造血干细胞移植后复发的白血病患者挽回了生命。