中国人民解放军总医院第五医学中心检验科担负着战时机动卫勤保障、平时反恐、突发公共卫生事件的应急处理和驻京部队官兵传染病的病原筛查、确诊任务，负责全院门诊、病房及首长特殊保健的所有临床检验任务，作为北京市传染病网络实验室，承担着地方传染病突发疫情的病原筛查、确证工作。

设有门急诊检验、临床生化检验、临床免疫检验、临床微生物检验、临床分子生物学检验、临床化学发光检验、临床个体化检验七个专业实验室。

实验室建筑面积近2000平方米，仪器设备近400台件，总价值约4000万元，已开展检测项目396项，全天候日检测能力达2.5万项次。

现有员工68名，其中高级职称9名。是解放军医学院、军事医学科学院、第三军医大学、北京大学医学部、河北北方医学院等单位博士、硕士研究生联合培养单位。现已经成为集医、教、研于一体的综合性医学实验室。

实验室在质量建设上成绩突出，是军队首家感染病临床实验诊断专科中心，国家临床重点专科军队医学检验建设项目单位。全国传染病医院首家通过“ISO15189医学实验室质量和能力要求”认可的实验室。

军队医院首家艾滋病检测确证实验室，军队医院首家“生物安全示范实验室”，军地传染病网络实验室、甲型流感确认实验室，医疗工作上特色鲜明，实现检测能力快、全，检测质量准、稳，检测技术特、新。

中心成立以来，独立承担国家重大新药创制、国家自然基金、首都发展基金、军队“十一五”、“十二五”重大、重点课题36项；获科研经费近1400余万元。以第一完成人获军队医疗成果二等奖4项，中华预防医学会科学技术二等奖1项。

军队科技进步三等奖3项，军队医疗成果三等奖4项。获国家发明专利4项，国家实用新型专利4项，国家三类医疗器械注册证2项、二类11项。主编出版专著4部，副主编专著11部，参编出版专著20部。

近三年撰写并发表SCI英文论著10篇，影响因子35.578，以第一作者发表统计源期刊论文86篇。中心荣获集体二等功、全国检验医学优秀检验科、全国群众体育先进单位、总后先进基层党组织、总后先进基层单位、总后文化工作先进单位、首都防治非典型肺炎工作先进集体、医院先进科室和先进党支部等31项殊荣。