北京731医院中医科建院时隶属于门诊内科，于1987年单独成立中医科，经十余年的发展逐步成熟，现分为中医、针灸二个专业组，主要承担本院门诊，病房及社区中医、针灸诊断治疗工作。

北京731医院五名医师组成，其中主任医师一名，副主任医师一名，主治医师二名，住院医师一名。

北京731医院中医科为综合性科室，病种涉及内、外、妇、儿、皮肤、五官诸科。中西医结合诊治各科疾病是本科特色，即西医诊断加上中医辩证，临床疗效大为提高，全科年均普通门诊15640人次，专家门诊5240人次，病房会诊320人次。

目前特别对以下病种治疗形成特色：阵发性心动过速，更年期综合征，咳嗽、慢性肾功不全，慢性泌尿系感染，宫外孕保守治疗、功血、顽固性荨麻疹、急慢性胃肠炎、脑血管病恢复期、类风湿性关节炎、失眠高血压病、过敏性鼻炎等。