广州市第十二人民医院药学，是集临床药学、科研、教学、药品供应等为一体的重要医技科室。下设有西药房、急诊药房、精神病院药房、中药房、西药库、中成药及饮片库、临床药学室等多个部门。药品供应部门严格按医院药事管理与药物治疗学委员会遴选的用药目录对药品进行采购和供应，为患者提高质量可靠、有效、经济的药品。

各专业临床药师大部分时间深入到心血管内科、肿瘤科、呼吸内科等科室，与临床医师共同制定规范化用药方案，利用合理用药软件系统优势，全面监控、监管各院区各临床科室用药的适宜性和合理性。