何贤纪念医院检验科，是医院的重点发展科室。检验科占地面积约500ｍ2，检验设备齐全，拥有全自动生化分析仪3台、全自动血球计数仪4台、全自动细菌鉴定仪1台、全自动血培养仪1台、全自动凝血仪2台、尿沉渣分析仪1台、酶标仪2台、血气分析仪1台、微量元素检测仪2台、荧光定量基因扩增仪1台、全自动化学发光免疫分析仪3台以及带有图像报告的染色体分析系统一套等先进的仪器设备。
检验科拥有一支综合素质较高的专业技术团队，目前专业技术人员35人，其中正高职称1人、副高职称6人、中级职称10人，本科学历21名（本科以上学历占56%）、硕士研究生3名（研究生以上学历占10%）。随着人才结构和梯队建设的不断更新，专业技术水平和检验质量也得到不断地提升，检验项目也由最初的三大常规到目前的多学科纵深发展，科室设有生化检验、临床检验、微生物检验、免疫检验、血液学检验、基因扩增检验（PCR）和遗传实验室、血库等多个专业组。
检验科经过2014年下半年和2015年上半年的整改和重组，不断地优化检验流程，缩短了报告时间。目前，检验科分为三部分：院本部检验科承担快速检验功能（门诊常规检验项目1小时出报告；住院部常规检验2小时出报告）；沙湾院区检验科也同时承担快速检验功能；沙湾院区中心实验室负责微生物检验、PCR技术、产前筛查和诊断等检验项目以及教学、科研、实验共建平台，成为医院硕、博科研论文实验基地。
目前医院检验科的专业技术水平位居全国同级医院的前列，开展的项目多达四百多项，配合医院学科发展的需要，检验科不断拓展业务，合理开展新技术和新项目。近年来开展的新项目有：2011年已开展的快速CRP、呼吸道病毒九项均取得了良好的经济效益和社会效益，特别是快速CRP开展以来对临床在抗菌素的应用方面起到重要的参考依据，各种病毒抗体的检测对抗菌素的使用起到重要的指导作用。2012年开展的项目有地高辛、氨茶碱药物浓度的监测，为临床提供及时有效的检验数据，取得良了的社会效益。
2014年已开展的同型半胱氨酸（HCY)、降钙素原（PCT)、淀粉样白蛋白（SAA)、骨磷酶（BAP)、自身免疫性疾病（RDB-PCR、GAP-PCR）、代谢性疾病筛查、肿瘤的分子诊断、MCA（溶解曲线分析技术）基因的测序。2015年以来新增开展了视黄醇结合蛋白（RBP）、骨源性碱性磷酸酶（BLP）、血氨、登革热病毒IgM、IgG、NS1抗原、流感病毒抗原、H7N9核酸检测等一批快速检验项目，不断满足临床的需要，为临床提供及时有效的诊断依据，并且取得了良好的经济效益，在沙湾院区中心实验室已全部开通开展可收费的检验项目1104项。
HIV初筛实验室、生殖医学实验室已通过上级主管部门的技术验收和复审，其中2006年9月1日基因扩增检验实验室是番禺、南沙地区第一家通过国家卫生部临检中心技术验收的实验室，2012年1月30日通过校检。现在已经有8名专业技术人员取得HIV初筛检验上岗证，有6名专业技术人员取得基因扩增检验上岗证，使医院的检验技术水平迈进一个新的台阶——分子诊断水平。
遗传实验室开展的产前筛查和产前诊断项目已向广东省卫生厅备案和准备申报技术准入，将成为番禺、南沙地区的产前筛查和产前诊断中心实验室。遗传实验室设有细胞遗传、生化免疫遗传、分子遗传和生殖医学实验室4个专业。
遗传实验室按照《产前诊断技术管理办法》相关配套文件、WS/T247-2005甲型胎儿球蛋白检测产前监测和开放性神经管缺损诊断准则、WS322.1-2010胎儿常见染色体异常与开放性神经管缺陷的产前筛查与诊断技术标准第1部分：中孕期母血清学产前筛查、WS322.2-2010胎儿常见染色体异常与开放性神经管缺陷的产前筛查与诊断技术标准第2部分：胎儿染色体异常的细胞遗传学产前诊断技术标准、医疗机构临床基因扩增实验室管理办法和医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则，建立了质量控制体系，制定了各种程序性文件、SOP文件以及各种质量记录。专人负责对筛查阳性病人进行管理和各项检查的原始记录进行统计分析和评估。
近几年来医院检验科取得番禺区科委科研立项3项、承担和参与广州市科研基金项目1项、广东省科委科研立项2项，广东省计划生育委员会科研项目1项，发表专业论文50余篇，有多篇专业论文参加国内和国际学术交流。每年派出1-2名专业技术骨干到国内“三甲”医院或国外进修学习，不断提高专业技术水平，促进学科建设的可持续发展。
检验科严格按照《医疗机构临床实验室管理办法》的要求建立全面的质量控制管理体系，加强分析前、分析过程和分析后的质量控制，制定了各种程序性文件、SOP文件以及各种质量记录文件。科室制定了《质量手册》《检验标本采集指南》《检验项目手册》，并不断完善，确保检验质量。按照2006年6月1日国家卫生部发布的《医疗机构临床实验室管理办法》的要求；ISO15189《医学实验室—质量和能力的专用要求》的认可要求，逐步把检验科建设成规范化、标准化、自动化、信息化、国际化的实验室。