胃肠外科是国家重点学科－中山大学普通外科的组成部分，目前设置床位50张。下设胃癌诊治研究中心、结直肠癌诊治中心、疝与腹壁疾病中心、肠瘘中心。医疗范围：主要治疗食管、胃、结直肠的良恶性肿瘤、消化性溃疡并发症、各类消化道大出血、胰腺疾病、肠瘘、肠梗阻、食管狭窄、贲门失弛缓症、肠系膜上动脉压迫综合征、成人先天性巨结肠、短肠综合征、腹壁疝、直肠脱垂、便秘、肛瘘、痔和炎性肠病等疾病。擅长食道癌根治术、胃癌根治术、胰十二指肠切除术、全直肠系膜切除术、保肛门保功能的直肠癌根治术、结肠癌扩大根治术、全结肠切除、回肠J型贮袋经直肠肌鞘肛门吻合术、严重广泛粘连性肠梗阻的小肠排列术、肠瘘的外科手术。除传统手术外，擅长胸腹腔镜食管、胃、结直肠肿瘤根治术及食管裂孔疝修补、胃底折叠等微创手术。