深圳市中医院感染性疾病科，前身为发热门诊，2003年4月，传染性“非典”流行期间，本院根据国家卫生部防控“非典”疫情，专门成立发热门诊。“非典”流行结束后，发热门诊主要负责就诊患者的传染病筛查、预警、防控和诊疗，对传染病进行早发现、早报告、早隔离、早治疗，及时控制传染病的传播，有效的救治感染性疾病，保护人民群众的身体健康，后期增加到发热和肠道两个门诊。

科内建立较为完善、合理的应急预案和就诊流程，对发现传染病进行诊断和治疗，及时上报控制疫情，并做好消毒隔离和卫生宣教工作。

2004年9月，根据国家卫生部二级以上医疗机构必须设置感染性疾病科的要求，本院感染性疾病科开始成立。内设发热门诊、肠道门诊，主要任务是排查SARS、人感染禽流感、不明原因肺炎、手足口病和肠道传染病等传染性疾病和规范临床抗生素的临床应用。

感染性疾病科成立以来，承受了多次的传染病流行的考验，2014年的埃博拉疫情、2015年的中东呼吸综合征和登革热疫情、2016年的寨卡病、黄热病疫情和2017年初的H7N9人感染禽流感疫情，本科的医护人员在医院领导的指挥下，按照国家的传染病管理要求，及时发布传染病疫情报告，传播传染病防治知识，规范传染病管理，对各波次传染病疫情做到早发现、早报告、早隔离、早治疗，对确诊的烈性传染病及时转移到定点医院。成立之日至今，无重大烈性传染病漏诊、漏报。

同时本科在人员紧缺、场地局限的情况下，承担全院的发热查因、传染病及传染病可能疾病的诊疗、抗生素的规范性使用的临床会诊工作，近几年全院的抗生素使用规范性明显提高。