广西壮族自治区南溪山医院胸外科创立于1977年，曾和心脏大血管外科在一起，是广西最早成立独立的胸心血管外科专业之一。近40余年来，在历届科主任的带领下，胸外科的发展处于广西领先水平，率先在桂北地区开展肺、食管、纵隔、胸壁等胸外科手术，近10年来，常规开展单孔胸腔镜下肺癌、肺大疱、全胸腔镜下食管癌及纵隔肿瘤等各类腔镜手术，胸部外伤、漏斗胸、手汗症、贲门失迟缓症、食道裂孔疝、膈疝等胸部疾病手术，复杂纵隔肿瘤和复杂中央型肺癌手术，重症肌无力的综合规范治疗，取得良好社会效益，年手术量近500台，且每年以10%的速度递增。

2017年7月胸外科从原胸心血管外科独立分科，现有床位32张，医生6人，护士16名，平均年龄31岁，其中主任医师2人、副主任医师1人，副主任护师1名，具有博士学位者1人，硕士学位者4人，多人在广西医学会胸心血管外科分会、广西医师协会胸心血管外科分会、桂林医学会胸心血管外科分会担任主委、副主委和常委等职务。

胸外科作为桂林市重点专科，位于广西区先进行列。全国住院医师规范化培训胸外科基地，科室承担国家自然科学基金2项及省厅级科研项目多项，每年培养硕士3名，规培生20人。科室每年承担桂林医学院的本科教学任务，并承担广西中医药大学、右江民族医学院、广西科技大学的实习教学任务。