南通市第三人民医院消化科，暨消化内镜诊治中心成立于2000年5月，消化科是南通市重点临床专科，消化内镜诊治中心、胰胆疾病中心是南通市第三人民医院重点发展科室，现有核定床位38张，设施齐全，设备先进，技术力量较雄厚，有专业医技人员13人，其中主任医师2人、副主任医师2人，医学博士1人、硕士3人，消化内镜专职护士1名。

学科主要带头人为市医学重点人才培养对象，具有20多年临床医疗、教学经历和7万余例各种消化内镜操作经验，曾到国外研修考察；胰胆疾病中心带头人师从国内著名消化病专家，并取得博士学位。

南通市第三人民医院消化科目前除对消化系统常见病、多发病进行诊断治疗外，每年尚要抢救上百例疑难重危患者，并承担南通大学、南京中医药大学理论教学和临床实习任务，可接受专科进修医生还承担了省、市、局多项培养科研课题有着每年均有数篇论文发现在专业重点临床杂志上积累发表，实现了医教研同步发展，特别是近几年消化科迅猛发展，经济效益和社会效益不断提高，已在南通市和周边地区形成一定影响。

南通市第三人民医院消化科在慢性肝病、肝硬化门脉高压、黄疸的鉴别诊断和治疗方面见长，各种消化内镜检查和内镜下全国治疗尤具特色。消化内镜诊治中心拥有最先进的日本进口系列电子内窥镜、超细胃镜、超声内镜及全套辅助治疗设备，在省市内较早开展了ERCP及内镜下胆总管取石和超声内镜项目，小儿内镜检查和内镜下治疗市内领先。

每年为数百名患者成立进行各种内镜下治疗常规开展胃肠息肉的内镜下摘除消化道异物的取出肝硬化食管静脉曲张破裂出血的硬化剂治疗合作皮圈套扎治疗专家小儿巨大肠息肉的内镜下切除胆管狭窄和食管狭窄的扩张治疗我国及支架置入ERCP及EST胆管取石术、放置胆胰管支架及阻塞性黄疸的内外引流、早期胃癌、食管癌、大肠癌内镜下局部切除术、肿瘤局部化疗、各种病因引起的食管贲门狭窄及术后吻合口狭窄的扩张治疗、放置食管支架、复杂食管、胃异物取出等。

部分抢救项目达到省市领先水平，胆道子母镜即将投入临床应用。胰腺疾病的基础和临床研究已取得初步成果，并列为省社会发展计划立项课题，为省内领先。