南通市肿瘤医院消化内科为南通市临床重点专科，学科带头人为杨磊主任。全科共有医师28人，其中博士9人(含博士在读)，硕士8人，硕士生以上人员占60.7%，高级以上职称人员占53,5%，省“333工程”第三层次培养对象(中青年学术技术带头人)1人，市“226工程”第三层次人才1人，市青年医学重点人才1人。

科室配备各种先进的医疗设备，包括电子胃镜、电子肠镜、电子支气管镜、超声内镜、超声电子气管镜、腹腔热灌注仪器、微量输液泵等，设备总值约1000万。科室常规开展各种消化道恶性肿瘤的规范化诊治，根据各种恶性肿瘤患者的不同基因表达状况开展个体化治疗和分子靶向治疗。

常规开展药物基因组学(或药物遗传学)在个体化化疗中的应用，应用腹腔持续循环热灌注化疗治疗恶性腹腔积液。科室配备普通电子胃镜、超细电子胃镜、电子十二肠镜及微波治疗仪、射频治疗仪、沙氏食管狭窄扩张器等专科诊治设备。

常规开展无痛胃镜和超细胃镜的检查及内窥镜下良、恶性食管狭窄扩张术和金属支架植入术、内窥镜下上消化道恶性肿瘤射频治疗术和肿瘤内注药术、内窥镜下胃息肉摘除术、十二指肠营养管放置术、内窥镜下取异物、消化道粘膜下注射止血、ERCP 等技术。

在“科教兴科”的推动下，科室在科研方面取得了较为突出的成绩：近年来获国家自然科学基金2项，省级课题2项，市级课题多项;获省医学新技术引进奖二等奖2项，市新技术引进奖一等奖2项、二等奖1项、三等奖1项，市科学技术进步奖三等奖1项。科室的消化肿瘤诊治水平在省内享有很高声誉，深得广大病员的信赖，先后获得省、市级多项荣誉称号。