南通市肿瘤医院妇科建于1973年，是集临床、教学及科研为一体的南通市临床重点专科，为国家宫颈癌早诊早治的最早联盟单位之一。目前科室拥有医师27人，其中高级职称人员16人，硕导3人，博士3人(含在读博士)，硕士12人，江苏省“333高层次人才培养工程”培养对象3人，南通市“226高层次人才培养工程”培养对象4人，南通市医学重点人才4人，学科带头人为何爱琴主任。

科室收治南通及周边地区60%以上的妇科恶性肿瘤患者，拥有一支强大的妇科肿瘤诊治团队，技术力量雄厚，在省内享有盛誉。科室设有日间放化疗、南北院门诊、后装治疗室等，在南北院共设三个病区，开放床位133张，每年收治妇科恶性肿瘤5000余人次。

科室拥有手术、化疗、放疗为一体的多学科诊治团队，严格遵循诊疗规范化、个体化和精准化的原则，与国家级肿瘤专科医院接轨，熟练开展妇科肿瘤个体化、精准化治疗，对化疗及手术后并发症的处理具有丰富的临床经验。

科室配备后装机治疗机、腹腔镜(宫腔镜)、阴道镜、LEEP刀、高频电波刀、固有荧光早期肿瘤诊断仪、微波手术治疗机等先进仪器设备;开展宫颈癌及子宫内膜癌的规范化根治手术、卵巢癌肿瘤细胞减灭术及联合脏器切除术、外阴广泛切除术加(或)腹股沟淋巴结清扫术、复发性、难治性妇科恶性肿瘤的规范化治疗等10多个重点专科项目。

开展保留生育功能的宫颈癌根治术、经阴道闭孔区中段尿道悬吊术、靶向药物治疗在复发性卵巢癌、宫颈癌中的应用、前哨淋巴结显影技术在子宫内膜癌手术中的应用、剖腹或腹腔镜下子宫肌瘤(腺肌瘤)剔除前行双侧子宫动脉阻断术、靶向药物治疗在复发性卵巢癌、宫颈癌中的应用等新技术项目。

作为南通及周边地区唯一一家具有近距离后装治疗先进设备的科室，收治几乎整个南通地区的宫颈癌放疗患者，每年收治宫颈癌放射治疗患者300余例，常规开展适形调强放疗技术，与国际接轨开展宫颈癌三维后装适型治疗，致力于提高宫颈癌治愈率及减少副反应，为整个南通地区宫颈癌的规范诊治作出了应有贡献。

科室重视学科的建设发展，科内有多人担任国家级与省、市级学会主委、副主委等职务，在“科教兴科”的推动下，科室在科研方面取得了较为突出的成绩。

近年来开展全国多中心临床试验3项，承担省、市级课题研究10余项，获得南通市医学新技术引进奖4项、科技进步奖3项，获省科技奖二等奖1项，在国内外期刊发表有影响力的论文20余篇，其中SCI 8篇，参与并修改南通大学教材《临床妇科肿瘤学》。