南通市妇幼保健院生殖健康科成立于2000年，中心发扬团队精神，依托医院实力，在临床、教学、科研方面形成了独特的技术体系。率先在苏中、苏北地区开展人工授精术，体外受精-胚胎移植、单精子卵胞浆内注射、胚胎玻璃化冷冻、囊胚培养、冷冻胚胎移植、胚胎辅助孵出、精子冷冻、卵子冷冻、时差摄影等辅助生殖衍生技术。妇科还开展各类宫腔镜手术、减胎术、囊肿穿刺等手术。男性科开展男科常规手术及显微手术，及各类男科专科检查。

2019年生殖医学中心业务量明显增加，年门诊量达到6万多人次。接受人工授精治疗600余例，周期临床妊娠率在14%左右。中心临床、实验室水平不断提高，取卵周期数1000余例，移植周期数1200余例。临床妊娠率稳定在68%左右，各项辅助生殖质控指标在全省名列前茅。生殖医学中心积极响应科技兴院的号召，注重学科发展及人才培养。2018年开始与北京协和医院、上海仁济医院男科签订长期合作协议。2020年与上海复旦大学附属妇产科医院朱晓勇团队合作成立复发性流产诊治中心。每月专家来院坐诊、指导，针对疑难病例会诊讨论，以讲座、沙龙等方式对学科前沿、科室管理等方面进行指导，提高临床诊疗水平。

中心近三年共发表论文30余篇，其中SCI 8篇，中文核心4篇。开展科研9项，其中省级科研3项。2018年生殖中心成立日间病房，常年开展宫腔镜、男科各类手术。为患者带来便利，减少患者经济负担，缩短品均住院日，带来了一定的社会效益。在院部及科室十四五规划中将加强男科的发展，以男科发展为入口，带动医院的泌尿外科的发展。