南通市妇幼保健院药剂科现设有药事科和药学部，具体擅长内容会有所不同。

药事科目前是南通卫生高等职业技术学校、南通市通州卫校药学实习基地。现有药学专业技术人员32人，其中高级职称7人，中级职称9人，具有硕士学位7人，含博士在读1名。全科有3人在省、市级学术团体担任副主任委员、常委、委员。

药事科是集药品供应、调剂、药品质量控制、科研和教学于一体的重要科室，设门急诊药房、病区药房、中药房、药品库房等部门。近年来，药事科在保障药品供应的前提下，努力推进药学服务从“以药品为中心”向“以病人为中心”的转变，努力提升药学服务水平，为广大患者提供更优质的药学服务。近三年科室获得省市级科研课题立项10余项；发表学术论文30余篇，其中SCI论文2篇，核心期刊论文10余篇；授权实用新型专利4项，软件著作权5项；获得南通市卫健委新技术引进三等奖1项。

临床药学部成立于2018年12月，现有药学人员9名，其中博士1人，硕士7人，高级职称4人，中级职称4人，获得国家规培证书的专职临床药师6人。全科有3人在省、市级学术团体担任副主任委员、委员和青年委员。科室践行“以病人为中心，合理用药为核心”的理念，努力提升全院的合理用药水平。目前主要开展的业务有药学门诊、处方点评、药学查房、用药监护、药品不良反应监测和MTD会诊等。近年来，新开展了围生期药物咨询和药物浓度监测（质谱法）等新项目和新技术。

临床药学部成立以来，重视教学和科研工作，是南通大学药学院临床药学专硕联合培养基地，承担南通大学药学院研究生和本科生的教学任务，目前有南通大学硕士研究生导师1人，临床药学专硕联合培养导师3人，培养临床药学专业研究生2人。近年来，全科获得国家自然科学基金面上项目、江苏省卫健委科研课题、南通市科技局基础研究课题以及市卫健委青年基金等各级各类课题多项。