镇江市妇幼保健院小儿外科，是集医疗、教学、科研、于一体的特色专科。科室目前有副主任医师2名，主治医师1名，住院医师2名，其中硕士研究生3名。

小儿外科诊疗范围：
新生儿先天畸形：食道闭锁、胆道闭锁、肠闭锁、肛门闭锁及会阴瘘、幽门狭窄、十二指肠梗阻（闭锁、环形胰腺、肠旋转不良）、膈疝、腹裂、脐膨出等。
普通外科：胆总管囊肿、先天性 巨结肠、门静脉高压、腹股沟斜疝、腹壁疝、阑尾炎、肠套叠、各种体表及皮下肿物、腹部外伤、消化道异物、甲状舌骨囊肿、颈鳃源性囊肿及瘘、淋巴管瘤、结、直肠息肉、肛周脓肿、肛瘘以及脱肛的手术治疗等。
肿瘤外科：肝脏肿瘤、畸胎瘤、神经母细胞瘤、肾母细胞瘤、血管瘤、淋巴管瘤等。
泌尿外科：隐睾、鞘膜积液、包茎、包皮过长、睾丸扭转、附睾炎、小阴唇粘连等。
普胸外科：新生儿气胸、小儿气胸、血胸、脓胸、肺大疱、胸廓畸形的诊治。
感染：新生儿皮下坏疽、蜂窝织炎、化脓性淋巴结炎、腹腔内感染、败血症及脓毒症等。
特色诊疗项目：腹腔镜（微创）治疗小儿腹股沟疝及鞘膜积液、小儿肠套叠治疗、小儿功能性便秘的特色治疗。