宁波市第二医院肛肠外科为院重点学科。设病床25张。中心以结直肠及肛门疾病的研究、诊断、手术和综合治疗为主，对慢性便秘有一系列的检查、诊断和治疗方法。近年来相继开展了低位直肠癌保肛手术、大肠癌综合治疗、大肠癌复发后再次手术治疗、慢性便秘的诊断和治疗、结肠全切+小肠储袋手术、直肠脱垂手术治疗、重度脱垂环形痔PPH手术、经骶、经会阴盆腔和下腹部手术等。

在肠镜下诊断和治疗众多大肠疾病。特别是大肠癌的诊断，大肠息肉肠镜下扎除等操作均十分熟练。对肛裂、肛旁脓肿、单纯性或复杂性肛瘘、内外痔、混合痔等各种类型的肛门疾病的保守治疗和手术治疗均有独特之处。学科带头人为省内著名肛肠外科专家、主任医师、浙江大学及宁波大学硕士研究生导师、现任宁波市医学会肛肠分会主任委员。《现代实用医学》杂志编委。科室承担省、市科研项目三项。