温州医科大学附属第二医院儿童感染科创建于上个世纪八十年代，是浙南地区儿童感染、传染病诊疗中心，浙江省医学会儿科分会感染学组组长单位。三十余年来，经过胡崇一、陈家健、陈一华、陈益平几代儿童感染传染病专家的传承、坚守与开拓创新，不断发展壮大，目前成为集医疗、教学、科研于一体的先进学科，医疗服务影响力辐射至浙南与闽北地区。

学科坚持以病人为中心，规范儿童感染性疾病的诊治，积极应对手足口病、麻疹、新型冠状病毒肺炎等突发公共卫生事件，建立病毒性肝炎、脂肪肝等疾病诊治及随访体系。1998年在全省率先开展了儿童肝穿刺活检标志性技术。2017年成立了浙江省首个儿童肝炎肝病中心。2018年与华盛顿大学医学院遗传学系基因组分析技术中心签约合作，致力于病毒感染临床和科研一体化发展。

现有医护人员30余人，其中专科医师16人：均具有硕士及以上学位，其中高级职称技术人员8人，硕士生导师1名，主治医师5人。科室现有专科床位40张，下设儿童肝炎及儿童寄生虫病2个亚专科，每年出院3000余人次，年门诊量3-4万人次。

儿童感染科承担了温州医科大学本科生、研究生、留学生、进修生和住培生的小儿传染病学的理论与临床的教学工作，多次举办国家级、省级继续教育学习班。目前承担包括国家自然科学基金（1项）、参与国家卫计委临床重点专科子课题（1项）、国家中医药管理局课题（1项）、主持完成或正进行厅市级课题10余项、完成2项临床药物实验。未来儿童感染科继续凝聚力量、行稳致远、开拓创新、臻于至善。