嘉兴市第二医院神经内科始建于20世纪70年代，目前两个病区，开放床位数92张，年收治患者约4000人次。2001年开始为嘉兴市卫生局医学重点学科。2013年11月成为嘉兴地区唯一的脑卒中筛查与防治基地医院。

2015年3月获得浙江省浙北区域专病中心建设项目，2017年顺利接轨上海复旦大学附属华山医院神经内科，2018年接轨上海长海医院脑血管病介入团队，进一步推动了学科的发展。学科针对嘉兴地区常见病、少见病，划分为脑血管病、神经免疫疾病、眩晕专科、记忆和认知障碍、神经肌肉病、神经遗传变性病、癫痫、神经康复等亚专科。

脑血管病亚专科作为重要的亚专科，在开展静脉溶栓和桥接动脉取栓，超时间窗溶栓、取栓以及其它血管内治疗技术同时开展了一系列从基础到临床的研究。引领了本地区的脑血管病救治水平，2018年被国家卫计委脑卒中防治工程委员会授予嘉兴市唯一一家"高级卒中中心"，以及嘉兴市卫计委批准的嘉兴市脑卒中医疗质量控制中心挂靠单位。

神经遗传变性病方面，率先在嘉兴地区开展"帕金森病、认知障碍"专科门诊，开展认知筛查、检测、随访、中脑黑质B超检查、嗅觉测试、人工智能辅助诊断帕金森病、步态分析预警帕金森病跌倒等技术。针对眩晕疾病，配备有眼震电图仪、视频头脉冲仪，眩晕专科技师。癫痫疾病方面，配备有长程视频脑电图、专科医师。

目前医护团队成员50余人，有多名医学专家担任省、市专业委员会委员。其中主任医师6人，副主任医师6人，硕士生导师4名，博士1人，在读博士2人，硕士9人，拥有嘉兴市学科带头人1名，后备学科带头人1名，嘉兴市"1030人才"2名，"351人才"4名。

培养硕士研究生9名，毕业7名，近5年来在省市立项的科研课题19项，11项获省市两级科研成果奖，在国内外及省内杂志上发表论文70余篇。科室近年来连续承办国家级、省级学习班10余次，在浙北地区享有较好的声誉。