嘉兴市第二医院肛肠外科建立于1981年，现有专科医师6名，专职护士1名，设有专科病房（住院部18病区）。全体医务人员坚持“安全、优质、高效、低耗”的医疗服务理念，以病人为中心，注重临床、科研、教育、培训和社会服务相结合。

病区主任曹晨曦，主任医师，中华中医药学会肛肠外科分会理事、浙江省中医药学会肛肠外科专业委员会常委、浙江省医学会肛肠外科专业委员、浙江省中西医结合学会肛肠外科专业委员会专业委员、浙江省医师学会肛肠外科专业委员会专业委员、嘉兴市中西医结合学会肛肠外科专业主任委员。

专科张九皋副主任医师，原嘉兴市中西医结合学会肛肠外科专业主任委员。本科室在结直肠癌的诊断及根治性手术方面具有丰富的经验。同时对肛瘘、痔疮、肛裂、直肠脱垂、肛门狭窄等疾病的治疗，特别对复杂肛瘘的切挂术及重度混合痔的治疗在市内有较高的声誉。该科配备有进口电子肠镜、痔黏膜圈套器、高频电凝电切发生器等诊疗设备。

开展无痛肠镜检查及电子肠镜下的各种手术，在肠道内窥镜诊治方面颇具特色，除常规的各种肠镜检查诊断外，已先后开展了肠镜下肠道息肉摘除，下消化道出血肠镜下止血治疗，早期肠道肿瘤的内镜下治疗。

率先在嘉兴地区开展混合痔PPH（痔粘膜环切术）新技术及手工PPH术，在保留肛管皮肤基础上大大减轻了患者痛苦；以及肛门成形术、肛门缩窄术、肠镜下硬化治疗或套扎治疗及术中肠镜检查等方面有丰富临床经验。年门诊量14000人次，年手术700余人次，电子肠镜检查2600人次，电子肠镜下手术300人次，其中无痛肠镜1300人次，发表论文20多篇。

 肛肠外科在我市是有很高的地位,主要是省中西医结合肛肠学会、省中医学会常委，嘉兴市中西医结合肛肠学会主任委员，在全市有较高的知名度，省内一定知名度。