嘉兴市第二医院中医科建于1954年，近年来发展迅猛，为院内一般专科。中医科下设两级专科如下：

1.中医内科：有主任、副主任中医师主诊，均为嘉兴市名中医，有几十年的医龄。中医内科自设立至今已有50多年历史，在几代名老中医的传帮带下已形成自己的治疗特色，在长期的医疗实践中，中医内科尤对消化、呼吸、泌尿生殖系统及老年性的一系列疑难杂症诊治，积累了丰富的临床经验，近二十几年来已逐步应用中西结合两法对病人进行诊治，均取得满意疗效，深受病家好评，自开诊以来已有百余篇学术论文在国家、省、市级医学杂志上发表。

2.针灸科：针灸科设立至今已有五十多年历史，在几代名中医的传帮带下，形成了自己的治疗特色，该科治疗颈肩疼痛、颈椎病、风湿性关节炎、类风湿性关节炎、面神经瘫痪、腰肌劳损、呃逆、小儿遗尿等症状疗效显著，并在冬病夏治方面积累了丰富的经验。对脊柱或四肢疾病、腰突症、坐骨神经痛、中风后偏瘫有较好疗效。

3.伤科：创建于1981年。特点：擅长用中西医结合临床治疗各种创伤、骨折。在治疗中贯穿“筋骨并重、内外兼治”。尤其对关节内损伤、脑震荡、颈肩痛、腰腿痛半月软骨损伤、骨关节疾病、痛风、骨质增生、骨质疏松症、骨不连结或延迟愈合，泌尿系损伤等均有丰富的经验。

4.推拿科：创建于1982年，特点：应用传统的推拿手法治疗腰椎间盘突出症、小儿肌性斜颈，假性近视眼、肩周炎、脊柱痛、坐骨神经痛、关节脱位等疾病有明显的疗效。

5.腰腿痛专科：成立于1992年，该科由临床经验丰富的副主任中医师主诊，运用中西医结合治疗腰椎间盘突出症、腰椎体骨质增生、腰肌劳损、骨质疏松症、风湿性关节炎、类风湿性关节炎、肩关节周围炎、坐骨神经痛等疗效满意。尤其对腰椎间盘突出症、腰椎体骨质增生有较好疗效。

6.中医肾病专科：该科开诊于1985年，历经几任老中医努力勤诊，运用中医药辨治急慢性肾炎、糖尿病肾病、慢性肾衰、尿毒症等积累了丰富的临床经验，取得良好的疗效。现由储水鑫主任中医师主诊，吸取现代医学病理诊断与实验室检查，以辨病与辨证相结合，丰富和延伸中医传统的辨证论治，延缓慢性肾衰的病程，提高患者的生活质量，促进该科对肾病的中医研究和临床疗效的新进展。

7.中医肿瘤专科：创建于1992年，在近二十年的临床实践中，对于各类肿瘤患者的中医治疗已积累了丰富的临床经验，对于各类肿瘤患者经手术、放疗、化疗后所出现的各种症状调理已取得了满意的疗效，改善了患者的体质，提高了患者的生存期与生活质量。