南昌大学第二附属医院普胸外科（原江西医学院第二附属医院心胸外科）建科于1955年，作为江西省胸外科专业的发祥地，本专科成为江西省第一批获得外科学（心胸外）博/硕士学位授予权的单位，先后培养胸外科专业博士生3名，专业硕士研究生30余名，培训省内外胸外科医生200余人，为省内各级相关医院的普胸外科建设和发展作出了巨大的贡献。
同时，普胸外科也是我省最早开展各类胸部手术的专科，在老前辈吴孙砚田、陈朋、胡大仁等教授的带领下，率先开展了肺叶切除术、胸廓改形术、食管癌根治术等高难度手术，为我省胸外科的发展奠定了基础。
近六十年来，普胸外科在肺部疾病、气管外科、食管良恶性疾病、纵隔肿瘤等方面开展了大量的工作，尤其是近几年在胸腔镜微创治疗、难治性胸部肿瘤扩大根治术、胸外科术后并发症治疗、胸部肿瘤规范化治疗和重症胸部创伤治疗等方面的临床和科研工作中取得了新的成绩，确立了学科在省内的领先地位。
科室简史部分
1995年，以孙砚田教授为代表的老一代心胸外科学者，成立了心胸外科专业，开始几年只有柳文建、黄贤同、卢葵元等少数几名心胸外科专科医生，规模小巧。建科初级，率先在省内开展肺叶切除术、全肺切除术、胸廓改形术、食管肿瘤切除食管胃吻合术、胸膜外塑胶球填充术、纵隔肿瘤切除术等普胸手术。
经过近六十年的发展，在孙砚田、陈朋、胡大仁、徐建军等科主任的带领下，普胸外科已发展为拥有68张床位（其中监护病床6张），集医疗、教学、科研为一身的综合性学科，为江西省内省级、地市级医院输送大量普胸外科高层次人才，能够开展涵盖普胸外科所有疾病的外科手术治疗。
每年开展胸外手术近1000例，其中胸腔镜微创手术近50%，完备的综合治疗措施和术后随访复查制度，显著提高了病人的存活时间及生活质量，成为江西省普胸外科的示范。
人才结构部分
整个胸外科团队现有医师9人，护士29人，人员配备数量能够满足目前业务量需要。医师队伍60%年龄在30-50岁年龄段，副高级以上职称占78%，博士学位2名，欧美访学归国人员3名，科室成员90%具有研究生学历，科室的主体是中青年技术骨干，学历层较高，梯队结构合理，具备发展潜能。
胸外科目前下属4个治疗小组，均由高级职称技术骨干带领形成具有自身特色的技术团队，能独立开展各项临床业务并处理疑难重症；各级医师严格根据医院规定的分级制度完成手术操作，低年资医师在各治疗组间实施定期轮转制度以帮助学习众家之长，了解掌握各种特色治疗技术。
科室负责人和高年资老专家帮助年轻骨干保持对高难度复杂手术技术的传统优势，协助各种新技术和特色的发展成熟，并以此为基础辐射全科，从而使整个科室在临床医疗技术上达到领先水平。同时医疗护理紧密配合，协调医疗和护理的临床路径和规范，围绕疾病诊治和患者服务开展临床工作，使得普胸外科整体实力得到进一步充实。
现任学科带头人徐建军、喻东亮、彭金华主任医师就是其中的杰出代表。科室的主要技术骨干多数具有出国留学经历，目前科室每年组织成员赴国外进修或交流学习。
科室硬件实力
作为江西省内普胸外科领先学科，临床技术水平处于省内领先水平，拥有拥有68张床位（其中监护病床6张）的普胸外科病房，以及设备齐全的心胸外科实验室，每年收治大量疑难普胸外科患者。
近五年中科室先后投入资金数百万，重点用于更新完善设备，现拥有胸腔镜影像系统2套、遥测中央监护系统1套、支气管内窥镜系统3套、超声刀2套等，医院的多排螺旋CT3台、核磁共振成像系统3台、食道超声内镜系统1套、电子胃镜等为普胸外科疾病的临床诊治和科研提供了坚实基础。
诊疗特色介绍
科室作为在省内率先开展普胸疾病手术治疗的学科，临床诊治技术已覆盖胸外科所有良恶性疾病、常见病、多发病和罕见疑难病，复杂疑难术式普遍开展，危重病例诊治能力和效果不断提高，代表创新能力的外科新术式和代表先进诊疗理念的新治疗模式屡有开创，外科并发症和死亡率不断降低，诊疗服务和技术输出辐射接近全省范围。
普胸外科现已经发展形成胸腔镜微创治疗、难治性胸部肿瘤扩大根治术、胸外科术后并发症治疗、胸部肿瘤规范化治疗和重症胸部创伤外科治疗等五大特色。
1、胸腔镜微创治疗：电视胸腔镜微创治疗项目是普通胸外科的特色，科室在省内率先开展了胸腔镜微创早期肺癌根治术、胸腔镜微创胸腺扩大切除术治疗重症肌无力、胸腔镜下食管手术、胸腔镜肺减容术、微创漏斗胸矫治术等较高水平的胸腔镜手术。胸腔镜治疗气胸、胸腔镜肺部肿物切除、胸腔镜胸壁肿物切除、胸腔镜纵隔肿物切除。
胸腔镜治疗手汗症、胸腔镜肺活检、胸腔镜胸膜活检术、胸腔镜胸膜固定术等已经成为常规手术。常规吻合器全胸腔镜管状胃Ivor—Lewis食管癌根治术已达国内先进水平。
2、难治性胸部肿瘤扩大根治术：
对于常见的胸部恶性肿瘤，科室开展了支气管袖式肺癌根治术、支气管肺动脉双袖式肺癌根治术、上腔静脉置换术、残胃食管癌结肠代食管术、肺癌复发二次手术、胸壁切除重建术等高难度手术。
3、胸外科术后并发症治疗：
对胸部手术后并发症的治疗一直是普胸外科的棘手问题，近年来科室在这方面取得了长足的进步和丰富的临床经验，先后应用手术/保守治疗方法治愈各期食管癌术后吻合口瘘/残胃穿孔、肺癌术后气管/支气管瘘。形成了一套行之有效的治疗经验，手术并发症治愈率明显提高。
4、胸部肿瘤规范化治疗：
普通胸外科除开展常规手术同时，在胸部肿瘤综合方面严格按照国不最新NCCN和UICC肺癌、食管癌治疗指南进行规范的淋巴结清扫，积极推动我省胸部肿瘤手术治疗的规范化。
5、重症胸部创伤外科治疗：
科室在省内率先成功手术治愈食管主动脉瘘，开展食管破裂外科治疗、各期气管/支气管胸膜瘘外科治疗、气管食管瘘手术治疗等，并应用呼吸机支持和床旁血液透析成功治疗危/重症多发外伤致全身多器官功能衰竭病例，各种支持治疗的应用使科室重症胸外伤、尤其是多发伤的治疗处于省内领先水平。
其中胸腔镜纵隔引流联合主动脉覆膜支架腔内隔绝术治疗食管异物导致的食管主动脉瘘已达国际水准。
教书育人方面
作为南昌大学附属医院，普胸外科承担南昌大学外科学-普胸外科专业的本科教学工作，每年接纳相关专业本科生见习、实习近数百人。学科为南昌大学硕士学位及博士学位授予点，现有博士研究生导师1名、硕士研究生导师5名，现在每年招收博士生1-2名，硕士生3-5名。
在研究生培养过程中，特别重视临床诊疗和科研技能的规范培养，以保证研究生毕业时有较强的实际工作能力和独立从事科研的能力。学科还担负省内危重病人会诊工作，接纳省内普胸外科医师的进修、培训，每年开展各类继续教育项目和学习班10余次，促进省内普胸外科疾病诊疗学术推广。
科研成果介绍
科研方面，科室具有优良的科研传统和良好学术氛围，科室为目前省内唯一承担国家自然科学基金和国家重大科学仪器设备开发专项任务的单位，近年来科室共承担完成国家级、省级、厅级基金30余项多项，资助金额超过500万元。
科室以江西省分子医学重点实验室、心胸外科实验室为基础、与东华理工大学“江西省质谱科学与仪器重点实验室”长期合作，在痰液质谱分析肺癌早期诊断和组织喷雾电离质谱(TSi-MS)直接快速肿瘤分析技术领域已取得阶段性成果，有关成果在TheAnnalsofthoracicsurgery和Scientificreports等国际知名期刊发表。先后多次获得江西省科学技术进步奖。