南昌大学第二附属医院心脏外科是江西省心胸外科专业的发祥地。心脏外科病区专门收治需要手术或介入治疗的心脏疾病患者。心脏外科病区于2003年被江西省卫生厅确认为江西省医学领先专业学科。本学科目前是江西省培养心脏外科专业人才的中心，是江西省第一批获得外科学（胸心外）硕士学位授予单位，现拥有博士生导师1人，硕士生导师3人，先后培养胸心外科专业硕士研究生30余名，培训省内外胸心外科医生100余人，为省内各级相关医院胸心外科的建设和发展作出了巨大的贡献。
本病区拥有床位50张和15个心脏外科ICU单位。现有主任医师、教授4名，副教授、副主任医师2名，医学博士3名，医学硕士6名，留学归国人员2名。在各级科学技术协会担任职务的有：江西省胸心外科学会名誉主任委员1名，副主任委员1名，常委1名；中国医师协会心血管外科分会全国委员1名，江西省心电协会常务理事2名。
心脏外科专业从上世纪50年代末完成第一例心脏手术以来，手术数量逐年增加，现心脏外科手术总量已超过6000台。心脏瓣膜置换及先天性心脏病的外科治疗一直作为传统优势项目。 近年来
冠心病
的冠脉搭桥术、心脏病的微创手术，大血管疾病外科及介入治疗，瓣膜成形术已列为常规性工作开展，并开展了心脏移植、左心室减容术，胸腹主动脉替换术等代表国际水平的高难度手术。
本学科在科研方面成绩显著，先后获得包括国家自然科学基金在内的各级科研课题20余项。获得江西省科技进步奖等各类奖项5项，鉴定成果10项，发表论文百余篇，出版专著3部。具有广泛良好的社会影响。
科室医疗特色
心脏瓣膜置换及先天性心脏病的外科治疗一直作为我科传统优势项目。近年来瓣膜成形术、
冠心病
的冠脉搭桥术、大血管疾病手术及介入治疗、先天性心脏病及心脏瓣膜疾病的微创手术已作为常规性工作开展，并开展了心脏移植、左心室减容术，胸腹主动脉替换术等代表国际水平的高难度手术。
1. 先天性心脏病：房间隔缺损、室间隔缺损；肺动脉狭窄；动脉导管未闭，法乐氏四联症。
2. 各种复杂性心脏病治疗：右室双出口；法乐氏四联征；完全性肺静脉异位引流；主肺动脉间隔缺损；心内膜垫缺损；大动脉转位等。
3.
心脏瓣膜病
：各类瓣膜置换术及瓣膜成形术。对感染性心内膜炎的手术治疗有独特之处。心房纤颤行迷宫手术亦有较好掌握。
4. 先心病合并肺高压：我科对肺高压的有15年的系统研究，取得较好的成绩。
5. 大血管疾病：马凡氏综合症Bentall手术，胸
主动脉瘤
根治术，主动脉夹层外科及介入手术。
6. 微创心脏手术：创伤小，不用正中开胸，保持胸廓稳定性，切口美观，术后恢复快。
7.
冠心病
：常规开展冠脉搭桥手术。
8. 心脏移植：成功完成心脏移植一例，该患者为江西省目前为止唯一存活6年的心脏移植患者，且当前生活质量良好。
作为江西省内首批心胸外科专业硕士学位授予点，近3年先后招收研究生12名，省内其他单位（江西省胸科医院、江西省中医院、江西省人民医院、赣南医学院第一附属医院）陆续挂靠本硕士点，开始招收心胸外科硕士研究生。所招收研究生均按期按质毕业。毕业当年就业率达100％，并均在地区级以上医疗机构从事工作。
教学科研情况
南昌大学第二附属医院心脏外科作为江西省医学领先专业学科，心胸外科近3年科研成绩斐然，先后承担国家级科研项目2项(共80万元)，国家重大科学仪器设备开发专项(100万元),省厅级项目9项，总科研经费达200多万元。经过省级验收的科技成果2项，新技术引进项目3项。并作为主持单位获得省科技进步奖二项。先后发表论文50余篇，其中在核心专业期刊发表论著27篇。