南昌大学第二附属医院甲状腺外科（普外），是江西省首家甲状腺外科专业科室，是江西省甲状腺外科专业博硕士学位授权学科点，由国内甲状腺头颈外科专家余济春教授在二附院甲状腺（普外）外科组基础上于2012年4月成立的。
其前身是普外甲状腺外科组，科室现有正高1人，副高3人，博士研究生导师1人，硕生2人，博士3人，硕士1人。科室现有床位72张，每年平均诊治病人4000余例，手术患者近3000例。
甲状腺外科方面：
科室采用国际先进的甲状腺外科核心技术“甲状腺被膜解剖技术”，对甲状腺疾病患者采用标准化、规范化和个体化的治疗原则。对甲状腺机能亢进、甲状腺癌、甲状腺瘤、结节性甲状腺肿、甲状腺炎及喉返神经损伤的诊断和治疗有着丰富的临床经验，科室的治疗能力已达国际先进水平。
2002年在国内最早介绍显微甲状腺外科的概念并提倡使用手术放大镜做甲状腺手术，还在国内首次提出Zuckerkandl结节，可作为寻找、解剖喉返神经的一个新标志。科室目前完成甲状腺手术一万五千余例。
科室开展以甲状旁腺功能保护、喉返神经探查术、喉返神经吻合术、神经移植术和颈部低领切口微创技术为基础的新型甲状腺外科操作理论和技术，术中直接原位保留或种植甲状旁腺和常规解剖和保护喉返神经，使喉返神经损伤率和甲状旁腺损伤率达万分之三，达到国际先进水平。
术中采取的不切断颈前肌肉、皮内美容缝合等技术，使手术创伤小、手术切口美观、术后恢复快。对于胸骨后甲状腺肿瘤的治疗，均采用颈部切口完整切除。对于甲状腺癌的外科治疗，特别强调个体化危险分级治疗和功能保全的外科治疗。
率先对于伴有颈部淋巴结转移的甲状腺癌患者采用横切口多功能保留改良颈部淋巴结清扫手术，并保留胸锁乳突肌、副神经和颈内静脉、颈外静脉、颈丛神经等，既保留了相关功能又改善了外观。并在全省率先开展了对晚期分化型甲状腺癌侵犯喉气管食道患者实施联合器官切除与修复，并取得了满意的治疗效果。
随着微创技术的不断发展，科室率先在省内开展腔镜甲状腺手术，包括经口、经胸、经乳晕，腔镜辅助下甲状腺手术、内镜辅助下腮腺、颌下腺手术等头颈部微创手术。
并在全省最早开展术中喉返神经功能监测技术，使甲状腺手术变得更精细准确。科室还率先开展了小切口甲状旁腺肿瘤手术，对慢性肾衰长期血透继发性甲旁亢施行甲状旁腺全切加前臂种植术，收效良好。
头颈肿瘤外科方面：
科室头颈外科团队现已完成各种喉癌、喉咽癌手术三千余例，还率先开展了多项国内省内高难度头颈肿瘤手术。1997年完成我省首例喉癌环状软骨上部分切除术（CHEP、CHP）、1998年成功进行全省首例颈段气管肿瘤切除加端端吻合术、1999年成功完成我省首例舌癌切除舌骨下肌皮瓣修复术。
并于2002年成功开展了我省首例全喉切除加“X”型气管造口成型术、2003年完成我省首例复发喉癌切除胸大肌皮瓣修复术、2004年完成全省首例颈段食道癌切除加小肠移植术、2005年进行首例保留喉功能的下咽癌切除加游离皮瓣修复术，2013年完成我省首例环状软骨上部分切除术加钛网修复术，有力地推动了我省头颈外科的发展。
该团队完成的其他高难度手术还包括：颈动脉体瘤切除术，咽旁间隙肿瘤、鼻咽癌挽救性手术、喉气管狭窄手术重建、臂丛神经肿瘤切除、颈根部肿瘤切除、腮腺肿瘤切除等。
设备齐全
本科室技术力量雄厚，设备先进。拥有甲状腺微创手术和术中快速病理活检系统、强生数码超声切割止血体系（超声刀）、神经监护仪、Storzs高清内镜摄像系统等国内最先进的诊疗设备。在江西省率先开展了许多新技术和新业务。真正做到了甲状腺头颈部肿瘤疾病手术量大，并发症少，并精心为病人制定先进而规范的综合治疗方案，深受病人的赞誉。
科研实力
在科研方面重点研究领域为：甲状腺疾病基因研究、甲状腺新手术方法、腔镜辅助甲状腺手术、甲状旁腺移植治疗、甲状腺癌标志物、甲状腺肿瘤影像学研究、甲状腺癌靶向治疗、喉癌喉功能重建、头颈肿瘤切除和修复等新方法。
科室先后主持并完成省厅级课题项目10余项，包括：省科委社会发展重点项目《分化性甲状腺癌标准规范化治疗》、省卫生厅《全喉切除加X型气管造口成型术》、《游离皮瓣在头颈部肿瘤手术中的应用》、《面正中翻揭上颌窦入路鼻咽纤维血管瘤手术》、《改良Majie—piquet喉癌喉功能重建术》。
《舌骨下肌皮瓣在头颈肿瘤手术中应用》、《电子喉镜与多层CT对喉癌手术评价》、省科委《下咽癌手术治疗与后喉功能保留》、省自然基金《平阳霉素加地塞米松治疗血管瘤的实验研究》等。
先后在《中华耳鼻咽喉－头颈外科杂志》、《临床耳鼻咽喉－头颈外科杂志》《中国耳鼻咽喉-头颈外科杂志》《国际免疫学》等学术期刊发表论文100余篇，有《中华耳鼻咽喉－头颈外科杂志》、《中国耳鼻咽喉-头颈外科杂志》、《中国医学文摘耳鼻咽喉科分册》《山东大学耳鼻咽喉眼学报》等学科杂志通信编委和编委。
教学方面
2003年获江西省耳鼻咽喉-头颈外科硕士学位授以导师，作为江西省唯一甲状腺外科专业科室，是江西省甲状腺外科（普外）专业硕士学位授权学科点，硕士研究生导师2人，已培养硕士研究生12名。并完成南昌大学本科、成教、硕士的教学工作，为我省甲状腺颈外部外科专科医师及住院医师规范化培训基地。
每年还接纳国内普外及耳鼻喉头颈外科医师的进修、培训，每年开展各类继续教育项目和学习班，促进我国甲状腺颈部外科疾病诊疗学术推广。
本科室是集甲状腺头颈部疾病医疗、教学、科研于一体的高水平治疗、研究中心。我们将以优秀的团队合作、先进的医疗技术、领先的设备仪器、舒适的就医环境、一流的管理水平，努力打造成江西省乃至国内区域性甲状腺头颈部疾病微创治疗中心。