上饶市第二人民医院一病区，于1989年9月1日随着医院的成立而开业运行，现为医院的重点建设科室，主要承担全市感染性疾病的诊治和公共卫生应急事件的救治任务。现设有结核病门诊、艾滋病门诊和住院病区，开放床位55张，副主任医师4名，主治医师5名。

主要设备有支气管镜、呼吸机、肺功能仪和监护仪等设备。收治的病种主要为急、慢性感染性传染病，目前主要以结核病、艾滋病和肾病综合症出血热为主，同时对一些不常见的传染病也有着丰富的临床经验，例如梅毒、布鲁氏菌感染、人禽流感、甲型H1N1流感、手足口病、钩体病、新型冠状病毒感染的肺炎等。尤其是在难治性结核和耐药结核，艾滋病合并机会性感染的诊断和治疗方面具有自己的特殊之处。