儿童健康管理中心（即儿童保健科），于2013年10月建科，包括儿童体检中心、及营养与喂养门诊、语言门诊、心理保健门诊、综合发展门诊、注意力与学习门诊、高危儿随访门诊等特色专科门诊。中心拥有儿科医生、五官保健医生、护士、营养师、心理咨询师、健康管理师、育婴师等综合保健团队，秉持“专业精神、温馨服务、综合保健”的服务理念，为0—18岁的儿童提供健康管理服务。是儿童医院重点培育学科，国家级儿科医师规范化培训的临床基地之一，是福州大学人文社科学院应用心理系的实习基地，福建职业卫生技术学院托育专业实习基地，福建省及福州市智力残疾鉴定指定单位。是国家级儿童保健基地重庆儿童医院儿童保健科学术团队合作单位。中心主持或参与国家级省级科研项目十余项，十七人次在国家级级及省市级学会任职。

开展项目

生长发育监测、儿童健康体检、五官保健、眼疾筛查、口腔保健、营养膳食评估、个性化营养方案制定、体重管理、骨密度骨龄测评、体成分分析、母乳成分分析、肺活量测评、脊柱活动度测评、黄疸筛查、胃肠功能测定、胃肠功能训练、神经心理评估、情绪行为评估、智力残疾鉴定、孤独症评估、语言评估与干预、注意力评估等

playproject孤独症家庭游戏治疗、注意缺陷多动障碍家庭系统性执行功能训练、原发性遗尿症阶梯式训练、各类家长课堂（语言课堂、孤独症课堂、行为课堂、营养课堂、抽动课堂、多动症系列课堂等）。