南安市医院外科是本院最早开展的外科专业科室。已广泛开展胃肠、肝胆胰脾、疝气、甲状腺、乳腺等良恶性疾病诊治工作。同时开展肿瘤的规范性化疗。疝气、甲状腺、乳腺、胃肠等小切口及微创手术也正在开展中。