福建省南平市人民医院肛肠科集诊疗、科研、教学为一体，始创于1958年，是我省医院中建立较早的肛肠专科，历史悠久，在闽北享有盛誉，是医院重点名中医专科之一，也是南平地区唯一拥有病房的肛肠专科。

2003年被省卫生厅确定为福建省肛肠病适宜技术培训基地。该科以中西医结合为主，突出中医特色，并不断吸收国内外专科发展的最新研究成果，为患者带来国内最新的治疗方法。专科采用独特的方法诊治肛门、大肠疾病，并研制出具有独特疗效的系列专科制剂。

开展无痛手术方面独具特色。专科对复杂性肛瘘、顽固性肛裂、严重环状混合痔、重度肛管狭窄、急慢性结肠炎、大肠黑变病、肛门皮肤疾病等疑难杂症临床疗效显著。对常见病、多发病的临床治愈率达98%以上，学术水平居省内先进。拥有进口纤维结肠镜，高频电刀等先进设备。纤维结肠镜检查技术娴熟，诊断准确，累积检查患者1000余例。