福建省南平市第二医院耳鼻喉科仪器设备为南平市最先进的科室之一，拥有丹麦产的纯音测听仪，脑干电反应测听仪，耳声发射仪，声导抗测试仪，咽鼓管功能测定仪等全套测听设备以及助听器验配仪，德国产的手术显微镜，耳显微电钻，鼻内窥镜及鼻内镜显像系统，动力系统，食道镜、支气管镜、支撑喉镜、电子动态喉镜，美国低温等离子手术系统，耳鼻咽喉多功能诊疗台，多功能微波治疗仪。

可开展鼓室成形术，半面痉挛的乳突径路面神经梳理术，面神经减压术，声带息肉、声带小结的发音显微外科，鼻息肉、鼻窦炎鼻内镜手术，阻塞性呼吸暂停低通气综合征的腭咽成形术，头颈肿瘤手术，腮腺、颌下腺肿瘤切除术及颌面骨骨折等手术。