南阳医专第二附属医院肛肠科是“全国中医肛肠学科先进名医工作室（站）”、“河南省肛肠名医工作室”。以学科带头人刘国军为首的专业技术人员12人，其中正高级职称1人，中级职称2人，初级职称9人，均在省级以上医院进修学习，开放床位25张。

该科设备先进，技术力量雄厚，是南阳市规模大、档次高的现代化重点专科，拥有全电脑肛肠检查治疗机、大肠水疗机、肛肠压力测定仪、肛肠生物反馈仪、中药熏蒸机等先进设备。以结直肠肛管功能障碍性疾病、结直肠肿瘤、肛周脓肿、高位复杂性肛瘘、环状混合痔、炎症性肠病的中医药诊治为六大发展方向。

重点开展了痔瘘全程无痛疗法、序贯疗法合灌肠治疗慢性结肠炎，全电脑射频术、电切电凝术治疗肛肠病，内套外切术治疗混合痔，中西医结合切开挂线术治疗复杂性肛瘘，瘢痕支持固定术治疗直肠脱垂，肛门间隙高位脓肿切开挂线术、大肠水疗配合药物治疗结肠炎、便秘，PPH、RPH治疗直肠下段粘膜病变，芍倍注射术、消痔灵注射术治疗痔病等先进技术具国内领先水平，具有微创、无痛、高效、快捷、避免复发、避免感染等优势。

研制的消炎止痛栓、丹黄生肌栓、痔瘘洗剂、结肠宁灌肠液、肠康胶囊等系列配方等10余种，临床疗效确切，中医特色突出。