驻马店市中医院肛肠科成立于1986年，是省级重点专科，全国肛肠病治疗协作组成员单位。该科本着“中医要精，西医要新，中西医结合”医院发展思路，形成一整套疗效独特、优势突出，充分体现“内病外治，外病内治”的中医治疗特色，治疗痔疮、肛瘘、肛裂、结肠炎、便秘等肛门、大肠疾病。

肛肠科拥有：“智能型肛肠压力测定仪”，“电子肠镜”，“电脑肛肠治疗仪”“大肠水疗仪”等先进诊疗设备，开展了“肛肠功能检测”“全结肠气钡双重造影”和“瘘管造影”等专科检查项目。

开发研制了“痔疮类”“便秘类”“肠炎类”和“外用药类”4大系列中药制剂20余种，应用于各类肛肠病治疗的全过程中。在先进技术引进和创新应用上，创造性地开展了“分段外剥内孔治疗环状混合痔”、“开窗留桥治疗复杂性肛瘘”、“三联术治疗直肠脱垂”、“一次性脓肿根治术”及“直肠前突结扎粘连术”等多种特殊手术新方法，以其“创口小、恢复快、预后好”等特点，在肛肠疾病的治疗中独具特色。

该科还不断致力于疑难病症的科研攻关，对慢性溃疡性结肠炎、先天性肛门闭锁、直肠阴道瘘、直肠前突、耻骨直肠肌肥厚、会阴下降综合征等常见多发的疑难性肛肠病，遴选了中药内服、外用及手术等中西医结合治疗方法，疗果显著，疗效持久，特色突出。