牡丹江医学院附属红旗医院消化病、内镜诊疗中心，随着现代医学的发展，内窥镜已广泛用于临床诊断与治疗。牡丹江医学院附属红旗医院消化内科-内镜中心拥有世界先进日本进口奥林巴斯主机4台，胃镜6条，肠镜7条，十二指肠镜2条，小探头超声内镜1条，超声内镜1条；日本进口富士主机1台，胃镜7条，肠镜2条，胶囊内镜1台，C臂机1台，高频电刀治疗设备。

科室14名专业护理人员配合消化科医生、麻醉科医生开展无痛胃肠镜检查，超声胃肠镜，ESD，EMR，ERCP，以及内镜下治疗，异物取出术等。