吉林大学第一医院甲状腺外科，成立于2005年，专门从事甲状腺、甲状旁腺及颈部各类疾病的诊断和治疗。是卫生部国家临床重点专科，国际内分泌外科医学会甲状腺及甲状旁腺疾病诊治培训中心，吉林大学第一医院内分泌外科中心，肿瘤微波消融培训基地，吉林省甲状腺疾病诊疗和创新工程研究中心，吉林省健康管理学会甲状腺外科委员会及青年委员会主委单位，博士后流动站。

甲状腺外科是一支由多年从事甲状腺疾病诊治及研究的资深专家和优秀的中青年医师组成的精英团队，是目前国内手术种类最全、数量最多的甲状腺外科中心之一。现有医生26人，其中教授4人，副教授4人，博士研究生导师3人，硕士研究生导师8人，在读研究生23人。开放床位88张。年接待门急诊患者超过88000余人次，年行甲状腺、甲状腺旁腺及颈部各类疾病手术5000余例，其中甲状腺癌手术超过3500例，难治性甲状腺癌及再次甲状腺手术600余例，平均住院日5.02天。

建科以来累计承担并完成国家、省部级科研课题50余项，获科研经费700余万元，发表学术论文380篇，其中SCI收录89篇，中华系列74篇；获省科技进步二等奖2项，省科技进步三等奖1项，吉林省自然科学成果三等奖1项，市科技进步二等奖3项、吉林大学医疗成果奖9项。科室每年主办国内、国际性会议及各类继续医学教育培训班，发挥专科龙头作用，带动提高了吉林省甲状腺及甲状旁腺疾病的诊疗水平。