吉化集团公司总医院肛肠外科是以腹腔镜微创外科、消化道肿瘤及疑难危重病治疗为工作重点的临床科室，拥有病床36张，其中主任医师1名，副主任医师2名，住院医师5名；拥有硕士3名，护士12名。

科室技术力量较强，整体实力居吉林市先进行列，尤其在腹腔镜微创治疗各种普通外科疾病及消化道肿瘤等疾病的治疗居吉林市领先水平，每年收治各类病人1000人左右，施行各种手术800余台，社会知名度较高。每年开展新技术新项目多项，科室坚持“人无我有，人有我优，人优我全”的工作思路，建立了“科室发展有重点，专业有特色，人人有专长”的发展目标。