武汉市第三医院小儿眼科是湖北省所有综合性医院中唯一设有以治疗儿童弱视及各种小儿眼病的专科，是医院的重点专科。早在1972年便在全省率先开展了儿童弱视斜视疾病的研究工作，10871年举办全省眼肌专业学习班，为全省各地县医院培养了专业技术骨干，建立了弱视、斜视防治网络。

1992年经市卫生局批准，在武汉市第三医院眼肌专业组基础上成立了武汉市儿童弱视斜视防治中心。1995年成立小儿眼科后，专业技术设备投入得到更大的发展，收治了来自省内外大量的弱视斜视患者，平均每年门诊量达上万人次，作各种斜视手术近千人次，弱视有效率在90％以上，斜视美容效果在95％以上。

科室具有完整的、斜视专科检查治疗设备：多功能视觉生理测定仪、同视机、电脑验光仪、角膜地形图仪、角膜曲率计、眼科A／B超、非接触性眼压仪、弱视综合治疗仪、多媒体双眼视功能检测及弱视综合训练软件、手术显微镜，为弱视斜视患者提供了一整套诊断、检查、治疗设备。