武汉市儿童医院小儿免疫科成立于2009年，是中部地区最早开办的小儿免疫性疾病专科，是该省唯一具有独立专科病房的小儿免疫科。

科室现有专科病床26张，开设有专家专科门诊。现有医护人员33名（医师14名，护士19名），其中博士学位2人，硕士学位11人。高级职称2人，中级职称4人。近年来选派多名专科医生赴美国、德国、香港等地研修学习。学科带头人现为中华医学会儿科分会免疫学组委员，中国医师协会儿童风湿免疫学组委员。

该专科承担着省内外儿科风湿病患儿门诊和住院诊疗工作，对儿童风湿免疫性疾病制定有规范的诊疗程序，与国内外领先技术接轨（如基因诊断、生物制剂的使用、血液免疫净化治疗等），积累了丰富的临床经验。尤其擅长诊治儿童类风湿性关节炎（幼年特发性关节炎），儿童系统性红斑狼疮，幼年强直性脊柱炎，幼年皮肌炎，系统性血管炎，川崎病，过敏性紫癜、顽固性荨麻疹，药物、食物过敏，过敏性咳嗽、以及小儿原发性及继发性免疫缺陷病。