四川大学华西第二医院小儿泌尿外科是国家区域(西南)儿童医学中心的重要组成部分，是医院在新的发展阶段，集华西第二医院儿童内、外学科群，并与妇科、产科加强专业互补的基础上，为助力华西医学进入世界一流学科，为广大妇女儿童提供更加全面优质的医疗服务而设立的新学科。

从2024年1月开始运行，集医疗、教学、科研为一体。目前科室共有医生7名，其中主任医师1名，副主任医师1名。位于我院锦江院区第二住院部7楼。目前开放床位数15张，主要涉及到小儿泌尿系统先天畸形及结石、肿瘤等的临床诊疗、教学和科研工作。目前已完成多台隐匿阴茎、尿道下裂、先天性肾积水、膀胱外翻等四级手术的诊治。已与我院肾脏内科共同建立小儿泌尿系统疾病中心，并在临床及科研上进行了深入合作。