四川大学华西第二医院感染儿科是目前全国儿童专科医院中为数不多、四川省唯一一家专门诊治儿童感染/传染性疾病的专业科室，是四川省危重型手足口病的救治中心，承担了四川省儿童感染性疾病的疑难危重会诊、省内外突发公共卫生事件的处置工作。

是中华医学会儿科分会感染学组和消化学组委员单位，四川省医学重点学科单位；执笔了《中国0至5岁儿童病因不明急性发热诊断和处理若干问题循证指南》。近十年来，主编和参编各类教材和专著十多部。

感染儿科的创建人刘正乐教授主持的乙脑减毒活疫苗的临床疗效研究，为我国乙脑减毒活疫苗走向世界做出了巨大贡献。我科在儿童感染性疾病及传染病，特别是儿童结核病的规范化诊断和治疗处于全国领先、国际一流的水平。

同时，我科参与了“十三五”国家科技重大专项课题《结核病多重组合诊断技术的多中心评估》，是全国主要参研的三家儿科团队之一；是国家卫生健康委“细菌真菌感染诊治培训项目”首批儿科培训班授课专家团队。

感染儿科还是全国《中国遗传代谢性肝病注册研究》项目协作组成员、华西儿童肝移植协作组成员、四川感染与肝病专科联盟会员单位，已与华西医院儿童外科和肝脏移植中心展开合作，承担儿童肝移植手术的前期准备和后期随访工作。