四川省科学城医院感染性疾病科，是从事全身感染性疾病、肝病、常见传染病、腹泻的综合诊治科室，对甲类传染病有进行初筛的能力。

感染性疾病专科：诊治各系统感染性疾病，尤其对发热、各类耐药菌感染、导管相关性感染、免疫功能低下者（气管移植术后长期应用免疫抑制剂者肿瘤患者）感染寄生虫感染等诊治积累了丰富的经验，并对医院各临床科室疑难重症感染患者的诊治发挥着重要的指导及咨询作用。

传染病专科：对常见传染病（如麻疹、水痘、猩红热、流行性乙型脑炎、流行性脑脊髓膜炎、细菌性痢疾、伤寒、手足口病、肝炎、肺结核等39种国家法定传染病）进行有效的诊治。

肝病专科：各种肝病（包括病毒性肝炎、酒精性肝病、脂肪肝、自身免疫性肝病、肝硬化各种严重肝病等）的诊断、治疗和预防，在重型肝炎的抢救治疗、慢性肝病个体化抗炎抗病毒和抗纤维化治疗等方面有丰富临床经验。采取综合措施救治肝硬化并发的消化道出血肝性脑病肝肾综合征成功率在本地区处于领先水平。

肠道专科：肠道门诊对各种肠道急慢性疾病（腹泻、炎症）积累了多年临床经验。