重庆医科大学附属儿童医院神经内科成立于1981年，属我国最早成立的小儿神经专科之一，集医、教、研为一体，为西部地区小儿神经疾病诊治中心。

现由神经专科病房、专科门诊、儿童癫痫诊治中心、临床神经电生理室、神经病学研究室5部分组成，并建立神经免疫诊疗平台，癫痫术前评估体系和专病治疗体系。历任全国小儿神经学组和罕见病学组副组长、小儿神经疾病专委会副主委单位；重庆医科大学附属儿童医院重点学科；全国脑炎协作组-脑炎专业诊疗中心；全国脊髓性肌萎缩症联盟成员单位，CAAE全国综合癫痫中心。

本中心现有121张专科病床，年专科门诊量近10万人次，年住院病人5000余人次，病人来源包括深圳、海南、西藏、新疆、广西、贵州、云南、浙江、四川等全国20多个省市，是西部地区儿童神经疾病诊治中心。

中心具备完整的小儿脑电图和电生理检测与监护系统，？2011年在国内率先进行小儿神经专业对癫痫病灶定位和系统性术前评估，推动重庆医科大学附属儿童医院癫痫手术的开展；生酮饮食、迷走神经刺激术等综合治疗，使难治性癫痫的治疗达到国内先进水平；建立神经肌肉病、脱髓鞘疾病、神经免疫性疾病、中枢神经系统感染等疾病的规范化诊疗常规，系统的神经电生理检测、遗传代谢病筛查、肌肉活检、基因诊断等技术，显著提高小儿神经疾病的诊治能力。

牵头起草和修订全国小儿脑电图检查操作规范和诊断标准。作为合作单位开展全球多中心药物临床试验7项。

本中心有专科医师23名，博士生导师1名，硕士生导师9名，其中正高职称5名，副高职称8名，博士16名，专科护士54名，神经电生理中心专业技术人员12名。先后派出9名医生到美国、德国、澳大利亚、加拿大等地研修。现任学科主任蒋莉教授是博士生导师，国务院政府特殊津贴专家，重庆市中青年突出贡献专家，重庆市儿科学学术带头人。

本中心对惊厥性脑损伤和周围神经疾病的实验研究达国际先进水平，先后承担国家自然科学基金19项、省市级课题30余项，发表SCI论文50余篇，获得省市级科技成果奖4项。共培养博士40余名，硕士130余名。