南通市通州区人民医院眼科为南通市临床重点专科，肩负着全区眼科医疗、教学、科研、防盲四大任务。拥有独立的手术室及诊室、检查室、治疗室，开放专科床位35张，年门诊20000多人次、年出院病人1600多人次。
眼科人才梯队合理，现有医生11名，其中主任医师3名，副主任医师3名，硕士研究生4名，1人为南通市医学会眼科学会副主任委员，1人为南通市医学会医疗事故鉴定组成员，1人为南通市质控中心副主任委员，2人被通州区残联聘为视力残疾鉴定组成员，2人被南京市医科大学、南通大学聘为兼职讲师。
科室十分注重人才培养，定期组织业务学习及疑难病例讨论，积极参加眼科专题学习班及学术交流活动，选派人员带课题、带目标到上级医院进修或短期专业培训，营造良好的学习氛围，做到细分专业，各有所长，学有所用。与此同时，充分利用上级医院沟通合作平台，请专家教授来院坐诊、指导、手术，有效提高科室业务水平。
科室能独立开展三级医院眼科规定的必备项目和部分疑难手术，在眼科疑难病症的诊断治疗方面取得显著成效，多项技术项目填补了地区空白并获奖。眼科配备功能先进、性能优良的仪器设备，如：德国手术显微镜、美国爱尔康超声乳化仪、日本拓普康眼底荧光造影仪及电脑验光仪、全自动接触眼压计、德国蔡氏光学相干断层扫描仪（OCT）、自动视野仪、同视机、曲率计、CO2冷冻器、眼科Ａ/Ｂ超、多功能弱视治疗仪、眼底相机、等离子灭菌器、卡氏消毒锅、彩色多普勒等，为医疗工作提供了强大的支撑。
眼科紧跟国际国内眼科医疗发展步伐，积极引进新疗法、新技术，结合临床进行技术创新，为通州及周边地区的眼科患者带来光明和希望。全科开展科研7项，其中4项科研获南通市科技进步奖，1项获南通市卫生局新技术项目二等奖，1项获南通市卫生局新技术项目三等奖，1项获通州区科技进步二等奖，在省级及以上杂志发表论文30余篇，参加国际、国内学术交流60余人次。全科医护人员始终坚持和发扬救死扶伤、全心全意为人民服务的宗旨和方向，瞄准眼科技术发展前沿，用专业技能和爱心呵护广大群众的心灵之窗。
诊疗项目：
微切口白内障超声乳化人工晶体植入术；
眼部良、恶性肿瘤摘除；
球内异物取出术；
各种复杂性青光眼手术；
泪道疾病诊治；
泪小管断裂、眼球破裂等复杂眼外伤诊断和治疗；
视网膜病变抗VEGF治疗；
各种疑难眼病诊治（如难治性青光眼、糖尿病视网膜病变、特发性眼痉挛、角膜病等）；
胬肉切除联合结膜移植及羊膜移植治疗眼表疾病；
逆行置放硅胶管治疗泪道阻塞及泪囊炎的手术治疗等；
眼整形美容术：双重睑，眼袋整形，面部微整形去皱；
综合验光、近视、弱视诊断与治疗，斜视矫正术。
特色技术：
1、复杂性白内障超声乳化联合人工晶体植入术
开展白内障日间手术，当日手术，当日出院，费用低、住院时间短，方便患者。
2、难治性青光眼的手术治疗
采用显微双巩膜咬切联合羊膜植入的方法诊治各种难治性青光眼，获南通市卫生局新技术项目三等奖。
3、视网膜病变抗VEGF治疗
4、泪道阻塞的治疗
5、眼部整形美容术
常规开展：双重睑术（双眼皮）、眼袋矫正术、上睑下垂矫正术、小睑裂综合症矫正术、眼睑缺损修复与重建术、上睑退缩矫正术、斜视矫正术、内外眦成形术、全结膜囊成形术、眼球摘除羟基磷灰石义眼植入术等。
6、斜视、弱视的诊治
拥有拓普康全自动电脑验光仪，综合验光，带状光检影镜、同视机、近视、弱视协调治疗仪等先进的检查和治疗设备，先后已为数百名斜视、弱视、近视患者进行治疗，获得满意疗效。