甘肃省中医院外治科，是由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成。外治科是目前全国唯一一家以中医为主体，集藏医、维医、蒙医、土医等民族医学外治疗法于一科的特色专科，目前开展外治项目已突破300种，并对多种民间濒临消失的外治疗法，进行抢救性的挖掘与保护。

科室设有泥疗区、穴位贴敷区、针疗区、中医美容区、吸入疗法区、刮痧拔罐区、中医伤科区、衣着疗法区、烟疗区等20个功能治疗区，经典打造头痛、失眠、视频终端综合症、颈肩腰腿痛、哮喘、性功能障碍、乳腺增生、黄褐斑、便秘九大病种的治疗。