云南省中医医院针灸科始建于五十年代，是云南省最早的针灸科，经过六十多年的发展和完善，成为了特色鲜明、中医优势突出的卫生部国家临床重点专科、国家中管局“十二五”重点专科建设单位、云南省针灸重点学科、云南省针灸重点专科、云南省中医名科，建立了云南省针灸协作网络。
现有高级职称13人，博士3人，硕士研究生导师7人，特聘国家级名中医王光鼎教授、张沛霖教授指导临床诊疗工作。针灸科是云南省及外国留学生、针灸临床硕士生等针灸人才培养基地，有国家级、省厅级科研课题三十余项，是云南省集医教研为一体的具有较强技术力量的针灸科室。
在疾病治疗上，突出针灸特色，应用中西医结合的治疗方法，以准确的诊断及治疗，为患者提供全方位的优质医疗服务。“关爱病人，疗效至上”是我们一贯的服务宗旨。
针灸是中国传统医学的奇葩，属于中医的一种特殊治疗方法，它是采用不同的针具刺激人体的一定部位，应用各种方法激发人体的经气，调整人体的功能，从而达到治疗疾病的目的。针灸科开展的传统治疗有：传统针刺、艾灸、天灸、温针、头针、耳针、舌针、项针、拔罐、穴位注射、穴位封闭、穴位激光照射、穴位埋线、小针刀、埋线减肥、脐灸疗法、浮针疗法、贺氏火针、子午流注、三棱针放血、芒针、火针、腕踝针、皮内针、中药外敷、中药熏蒸等。
目前针灸科有100张病床，采用针灸传统治疗手段，充分利用针灸治疗疾病的优势，特别是在脑病及神经康复方面，科室设立卒中单元，集中医和现代医学先进治疗手段为一体，配备现代化康复器材，为中风等脑病患者提供更为全面及疗效更佳的康复治疗。康复开展作业治疗、物理治疗、失语治疗、吞咽治疗。
科室开展卒中单元(中风及中风的康复治疗)、心身疾病(郁证、失眠等)、中药外治(三伏天灸、脐灸疗法)、治未病、吞咽障碍、脊柱病（颈腰椎疾病、截瘫）、针灸国际教育与对外交流合作等优势项目，为患者提供更为全面的康复治疗。
诊疗范围
一、脑病及创伤康复：中风及其后遗症(脑血栓、脑梗塞、脑出血)，脑炎及脑外伤后遗症，脑血管性痴呆，脑供血不足，脑萎缩，记忆力低下，早衰，帕金森综合症，舞蹈症，脊髓损伤，运动及外伤所致各种损伤。
二、神经系统病症：面神经麻痹(面瘫)，三叉神经痛(面痛)，面肌痉挛，失眠，郁症，神经衰弱，癔病，神经官能症，植物神经功能紊乱，多发性神经炎，痿证(肢体萎软无力和肌肉萎缩、侧索硬化、重症肌无力、肌营养不良症、小儿麻痹后遗症等)，癫痫，桡、尺、腓总、胫神经麻痹。
三、骨与关节病症：腰痛(腰椎间盘突出症、腰肌劳损)，骨质疏松症，痹证(颈椎病、颈肩腰腿痛及关节疼痛麻木或不温、风湿性或类风湿性关节炎、坐骨神经痛)、扭伤(附：腰扭伤及其他关节扭伤和落枕)，劳损(附：老年性骨关节炎)，肘劳(附：肱骨外上髁炎)，肩周炎。
四、内科病症：眩晕(附：高血压)，失眠，头痛，痛风，疲劳综合症，冠心病，感冒，咳嗽，哮喘，呕吐，胃痛，呃逆(打嗝)，腹痛，便秘，脱肛(附：胃下垂及子宫脱垂)，小便不利及遗尿(附前列腺炎)，水肿，遗精(附：阳痿、男性不育)。
五、妇儿科病症：月经不调，更年期综合症，急慢性盆腔炎、附件炎，痛经，经闭，崩漏，胎位不正，乳少，子宫脱垂，不孕，经行乳房胀痛，妊娠呕吐，阴痒，阴道炎，疳积(附小儿厌食及消化不良)，小儿食积，小儿脑瘫，小儿多动症。
七、五官科病症：近视，眼干眼涩，暴盲(附：视神经萎缩)，斜视，眼睑下垂，耳鸣，耳聋，牙痛(附：牙周炎、龋齿)，鼻渊(急、慢性鼻炎、鼻窦炎、过敏性鼻炎)，咽喉肿痛(急慢性咽炎、声音嘶哑)，口疮(口腔溃疡)。
八、痛证：头痛，颈肩腰腿痛，痛经，胃痛等各种疼痛性疾病，乃至癌性疼痛。
九、美容美形：穴位埋线减肥，戒烟，美容，延缓衰老。
十、其他：各种疑难杂症。
针灸科在几代针灸人经过六十多年的努力发展下，拥有了一支技术力量雄厚的多学科交叉联合的医疗技术团队，具有较强的急危重症处理能力及专科诊疗能力。科室完整合理的人才结构梯队，形成了科室鲜明的学术思想及特色优势，形成了科室注重针刺手法及针刺量效基础的治疗优势，特别是应用特殊针刺手法治疗疾病的特色优势尤显突出。
针灸科特色针刺技术：升阳通督针法、通咽利窍项舌针法、调心开窍针法、夹脊排刺针法、缪刺合井穴刺络放血法、穴位埋线减肥、小针刀、浮针疗法、贺氏火针疗法、子午流注等特色针刺技术。
针灸科特色优势项目：卒中单元项目(中风及中风的康复治疗)、心身疾病治疗项目、治未病项目、中药外治项目(天灸)、吞咽障碍特色治疗项目、脊柱病特色治疗项目、针灸国际教育与对外交流合作项目。
针灸科特色门诊：中风专病门诊、吞咽困难专病门诊、失语专病门诊、穴位埋线减肥门诊、心身疾病专病门诊、脊柱病专病门诊、小儿脑瘫、斜视复视、月经不调特色门诊。
针灸科注重国内外技术合作与交流，与天津中医药大学附一院针灸部、北京东直门医院、江西省中医院、浙江省中医医院、南京市中医医院、黑龙江中医药研究所、成都中医药大学针推学院、湖北中医药大学针推学院、泰国宋卡王子大学医学院建立了科研、人才培养等合作关系，并签署相关合作协议，联合开展医疗、教学、科研等学术活动。
针灸科注重全省针灸技术的帮扶、共同发展、资源共享，引领并促进了云南省针灸学科的发展。
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