昆明市儿童医院康复科目前是云南省康复医学会儿童发育与康复专业委员会主任委员科室，昆明市第二周期、第四周期重点学科，是云南省内规模较大、设备较齐全的集诊断、治疗、康复于一体的综合性儿童专科康复医疗机构，2009年被省卫生厅评为云南省儿童康复医学研究中心，下设昆明市儿童生长发育与心理健康研究中心。
昆明市嗓音言语疾病诊治研究室、云南省婴幼儿高压氧治疗技术培训基地，和上海复旦大学附属儿科医院联合建立成为高危儿早期筛查及儿童康复技术协作基地。2014年8月成功申报成为云南省级重点学科建设项目，是中国残联、云南省残联“七彩梦行动计划”贫困儿童智力残疾和贫困自闭症儿童康复救治项目承担定点科室，自2005年始承担了昆明医科大学康复治疗学专业、海源医学院康复治疗学专业有关儿童康复的部分大课教学和见习、实习工作。
科室设有高危儿早期随访和脑性瘫痪、精神发育迟滞、语言发育迟滞、肢残的综合性康复等专科门诊，设有运动治疗室、作业治疗室、情景化互动治疗室、SET训练室、理疗室、中医推拿针灸室、高压氧治疗室、智能评估和早期干预室、语训室等综合性康复治疗室。
拥有一定的现代康复训练器材和设施，针对小儿生长发育过程中出现的异常或/和功能障碍进行定期保健检查、定期评估、早期发现问题后进行康复诊治，同时，所开展的科研和教学为促进临床服务能力的提升发挥了积极作用，提高了科室的综合实力。
科室技术特色鲜明，如脑瘫及肢残康复以紧紧围绕高危儿监测与小儿脑瘫早期诊断、康复治疗的研究方向，与省市医院各级产科、新生儿科、妇幼保健院合作，大力开展脑损伤的预防性康复治疗已初见成效，在“高危儿定期评估和早期干预”方面，居省内先进，并弥补了我省对高危儿医学监控的空白。
在“脑损伤儿运动、精神行为、感觉发展和发育异常的早期诊治研究”“早产儿低体重儿脑神经发育状况的早期随访调查及影像学评估方法”、“全身运动质量评估对早产低体重儿早期预测脑损伤的应用研究”方面的研究水平居国内先进，为推动昆明地区建立高危儿监测网，并逐步形成省级高危儿监测网络打下了基础。
科室开展的治疗项目有：运动疗法、作业疗法、SET训练、情景化互动训练、理疗、针灸、推拿、高压氧治疗、言语康复、心理康复等儿童综合性康复手段。
言语康复以紧紧围绕听性言语障碍、唇腭裂修补及术后儿的语音康复、嗓音和言语障碍的评估及矫治的研究方向，大力开展言语康复治疗和研究，弥补了我省对言语语言障碍儿专科康复的空白，“舌系带过短引起言语障碍的程度与矫正方法的研究”、“儿童发声障碍评估和多媒体矫治效果的研究”、“构音器官异常引起语言障碍的临床研究”、“脑瘫儿言语障碍的管理策略研究”方面居省内领先、国内先进。
开展的治疗项目有：功能性构音障碍；唇腭裂术后语音康复；口吃矫治；舌系带术后语音康复；长期声音嘶哑、中重度听力减退引起言语障碍；中枢神经性引起的语言障碍。心理康复从生物-心理-社会角度出发，对患儿的损伤、残疾和残障问题进行心理干预，以提高残疾患者的心理健康水平，以紧紧围绕对残疾患儿及家长开展心理康复，探索康复工作中心理康复的作用及应用，提高康复疗效，提高患儿康复治疗的依从性。
对帮助患儿恢复身体功能、克服障碍，以健康的心理状态充分平等地参与社会生活发挥了重要的意义。已建立的“高危儿随访与干预、脑性瘫痪及肢残儿童的康复、嗓音言语疾病的康复、其他各类发育迟缓儿康复”四大学科发展方向，开展着构建完善康复医疗服务体系、康复医学亚专业建设、康复医学住院医师、治疗师规范化培训等相关工作。
拥有的“高危儿定期评估和早期康复干预技术、神经心理行为评估技术、嗓音言语治疗技术、情景化互动训练技术、悬吊训练技术、作业治疗技术、规范的婴幼儿高压氧治疗技术、电刺激引导下A型肉毒毒素注射技术和儿童心理康复技术”等特色技术属省内首创。根据《“十二五”时期康复医疗工作指导意见》的精神，坚持“注重预防、治疗、康复三者结合”的原则。
科室将建设成为“云南省儿童康复医学技术资源中心（即三级儿童康复中心）”：建立“云南省儿童康复技术示范基地”、“云南省早产儿监测网络”、“云南省早产儿超早期康复处置中心”和“规范化的儿童康复护理单元”４项建设，进一步完善门诊部、住院部的设置，拥有更加齐全的医疗保健设施和现代化康复医学设备、成熟的早产儿监测网络及超早期康复处置技术、多专业组的儿童康复治疗技术和儿童康复特色护理单元。
承担云南省儿童康复治疗师规范化培训工作和早产儿早期筛查技术推广工作，和省市区各级残联紧密合作，建立一套统一协调、分级管理的儿童康复管理、服务网络。为全省发育异常儿童和残疾儿童提供更全面、精确、仔细的评估、检查、诊断、鉴定和康复治疗。
科室带头人为云南省康复医学会儿童发育与康复专业委员会主任委员，中国康复医学会儿童康复专业委员会委员、中华医学会全国物理与康复学会青年委员、中华预防医学会儿童保健分会青年委员、云南省康复协会治疗学专业委员会副主任委员、云南省残疾人康复协会智力残疾康复专业委员会副主任委员、云南省高压氧管理协会副主任委员、省医学会高压氧分会副主任委员、云南省医学会物理医学与康复学分会副主任委员、昆明市康复医学质量控制中心副主任委员等，云南省残联康复中心、昆明市残联、五华区残联儿童肢体残疾康复专家组外聘专家，昆明市卫生局学术技术带头人、昆明市康复医学会副主任委员、昆明医科大学医学院兼职教授。
2014年4月，刘芸主任参加全国第六届全国儿童康复第十三届全国小儿脑瘫康复学术会议暨国际学术交流会议，并作大会发言的学术交流；年内科室成员也参加了学术活动的交流。
全科人员在科室带头人的带领下，乘医院发展之风帆勇往直前，为共创儿医人的梦想而努力！