新疆维吾尔自治区中医医院风湿科创建于1997年，是新疆第一家中西医结合系统规范治疗风湿免疫性疾病的风湿病专科，长期致力于风湿免疫的临床及科研工作。对于类风湿关节炎、强直性脊柱炎、系统性红斑狼疮、混合性结缔组织病、干燥综合征、各种血管炎、白塞病、痛风、硬皮病、纤维肌痛症、风湿性多肌痛、多发性肌炎、皮肌炎、骨关节炎、产后风湿、银屑病关节炎、抗磷脂抗体综合征、幼年特发性关节炎、复发性多软骨炎、IgG4相关疾病等风湿免疫疾病的中西医诊治有较深入的研究，处于国内先进水平。

中医特色治疗包括“五毒通痹”系列中药口服，中药熏洗，穴位贴敷，中药封包疗法，中医针灸推拿疗法等，西医治疗主要有免疫抑制剂、生物制剂、关节腔穿刺治疗等。科室现有风湿免疫病专科医师12人，其中主任医师1人、副主任医师3人，主治医师5人，住院医师3人。目前核定床位60张，年收治病人3500余人次，年门诊量超3万余人次，病床使用率达150％以上。

科室承担中医内科学、中西医结合内科学、内科学及哈医学等本科及研究生教学任务，同时承担全疆规培生、研究生、进修生及本科生临床带教任务。科研方面共承担国家自然科学基金2项，自治区自然科学基金2项，乌鲁木齐市科技局项目1项，新疆医科大学科研创新基金4项，参与上海市中医临床基地建设横向课题1项。

平均每年发表学术论文10余篇。科室牵头分别于2014年、2017年成为新疆中西医结合学会风湿病专业委员会和新疆中医药学会风湿病专业委员会的主委单位，2019年成为中医民族医药学会副会长单位。