新疆维吾尔自治区中医医院针灸科为新疆自治区重点学科，国家“十二五”重点专科，“第四届全国中医冬病夏治学术交流大会”先进单位，针灸科下设两个科室，针灸一科和针灸二科，针灸一科主要负责针灸门诊及全院出诊工作，针灸二科主要负责针灸病房诊治工作。

针灸一科在马忠教授的领导下，在针灸治疗面瘫、中风、各种痛症等领域形成了一定的特色和优势，在国内同行及周边国家中具有较大的学术影响和较高的学术地位。

针灸一科共有医护人员45名，其中高级职称人员9名，具有硕士学位人数38名，护理人员5名。

针灸一科现设立了面瘫专科、中风专科、疼痛专科等；建立了中医中风病、面瘫病、腰痛病等临床规范化诊疗方案，经治病症上百种，在内、外、妇、儿、骨伤、五官、皮肤等科常见病及疑难病的治疗上突显出独特的治疗优势。

针灸二科配备了一支专业技术过硬的医疗及护理队伍，全科共有23名医护人员。医生共9人：硕士研究生7人，大学本科2人，正高级职称2人，中级职称3人，初级职称4人。护理人员13人：主管护理师6人，护理师5人，护士2人。

知识结构和年龄结构合理，人才梯队结构完整。现开放床位60张，年住院人次1600余人次，病床平均使用率超过100%，并设立面瘫组、中风病组、骨关节病组、痛证组、风湿免疫组、痿病组、中医杂病组、穴位埋线组等，为了进一步提高科研能力，科室还专门组建了科研攻关小组，成立了浮针研究室、铍针研究室、穴位埋线研究室、腹八针研究室、头针研究室、腕踝针研究室、平衡针研究室；采用普通针刺、电针、温针、浮针、腹针、雷火灸、隔物灸、穴位埋线、穴位注射、耳穴贴压、放血疗法、中药调理等多种疗法，综合治疗急性腰扭伤、运动性软组织损伤、颈椎病、腰椎间盘突出症、肩关节痛、膝关节退行性变、面瘫、截瘫、各种神经损伤、肥胖病、失眠、头痛、偏头痛、亚健康、月经病等疾病疗效显著。

病房建立了中风病组（出血中风、缺血中风）、面瘫病组、颈肩腰痛病组、痿证病等临床规范化诊疗方案，承担国家优势病种“面瘫病”的规范治疗及临床路径观察。目前针灸二科近几年主持参与课题5项，发表论文20篇，参编教材数本，推广中医适宜技术3项，举办继续教育学习班4次。针灸二科已组建成一支技术娴熟、经验丰富，团结协作，应急能力强，专科技术素质好、中医特色浓厚的专业医疗队伍；

以其较强的专业特色在新疆地区享有较高的知名度及影响力，并以优质的服务、精湛的技术获得新疆地区人民群众的好评。作为新疆医科大学的教学基地，针灸二科自成立以来培养了20余名研究生及实习轮转人员和各地州进修医生，并逐步发展为临床、教学、科研一体化的临床科室。