新疆维吾尔自治区中医医院肛肠科始建于一九五九年，经过几代名老专家的不懈努力，坚持中西医并重，中西医结合的发展方向，立足新疆并面向全国。建立了具有明显地域特色和中医特色的重点特色专科，属自治区重点专科建设项目。在这六十多年发展过程中，继承了前辈们的优秀文化遗产，吸取了北京、南京、天津等国内著名肛肠专科医院的先进经验，打造了在全疆范围内享有一定美誉度的医、教、研为一体的优秀团队。

目前具有专业人员二十五名，其中医生十名，护士十五名，医生中主任医师三人，副主任医师两人，主治医师五人，硕士六人，硕士生导师四人。现有固定床位58张，常住院病人100人左右。每年有几十名全疆各地进修人员到本科学习，已批准设立硕士研究生点，是国家中医药管理局重点专科的协作单位。

目前科室形成了具有中医特色、中西医结合治疗肛门大肠疾病有特色的科室，特别在一些疑难病上有较大的优势，如大剂量中药保留灌肠治疗非特异性溃疡性结肠炎；中医药治疗习惯性便秘；直肠阴道接修补；陈旧性会阴I度撕裂修补；肛门皮肤病治疗；盆地疾病治疗；藏毛窦根治术；高位复杂性肛瘘部分切开挂线术；环形混合痔分段保留齿线切除术；肛门直肠脓肿内口定位根治术；直肠脱垂点状、柱状综合治疗术等。

肛肠科全体医护人员将继续努力，以“一流的技术、一流的设备、一流的服务”为宗旨，以雄厚的综合实力为患者提供领先水平的，全方位的医疗服务。