巴彦淖尔市医院耳鼻喉科始建于70年代，经过几十年的发展，已成为拥有35张床位的专业科室，现有主任医师3名，副主任医师4名，硕士研究生1名，年门诊量15000余例，年手术例数800余例，年住院病人1200余人。

耳鼻喉科目前拥有美国产鼻内窥镜手术系统，德国耳科显微镜、美国耳科电钻，丹麦产纯音测听仪、中耳分析仪、丹麦麦德森耳声发射，脑干诱发电位、新生儿听力筛查仪，美国产低温等离子射频消融仪，率先在内蒙古西部开展了鼻内窥镜下鼻腔、鼻窦微创手术，创伤小、治疗彻底、术后恢复快。对于喉癌病人的“全喉切除术，保留喉功能的半喉切除术”。

治疗耳腔恶性肿瘤的“鼻侧切开术”，“上颌骨全切除术”多次获得巴市医院“三新”技术一、二、三等奖，低温等离子射频消融仪是耳鼻喉科引进的目前国际上最先进的治疗鼾症、腺样体肥大、扁桃体肥大、慢性肥厚性鼻炎、过敏性鼻炎的仪器，耳鼻喉科门诊拥有综合治疗仪4台，有清晰的显像打印系统，并与北京各大医院有密切联系，随时可请知名专家来巴彦淖尔市医院手术，为巴彦淖尔市300万人民的耳鼻咽喉健康保驾护航。